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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004509`

染色体: Chr07 坐标: 57749489-57750472 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004509`
名称	SmilChr07G004509
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57749489 - 57750472 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994491`
GeneID	`130994491`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994491`
原始查询	`SmilChr07G004509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=high
产物	orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=46.3; qcov=0.7; evalue=8.84e-67; confidence=high
Rice	`gene-orf490` (orf490) - identity=48.3; qcov=0.976; evalue=5.18e-101; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994491

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775517.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775517.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775517.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775517.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775517.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57749615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B134,C78
`Chr7:57749745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:57749790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:57749800`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B1
`Chr7:57749800`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B1
`Chr7:57749807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:57749829`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	41	A16,A19,B10,B100,B101,B107,B118,B120,B121,B122,B125,B24,B36,B43,B44,B46,B53,B59,B62,B65,B71,B84,B86,C1,C2,C28,C30,C35,C45,C6,C67,C72,C73,C8,C81,C82,D10,D11,D5,D6,D8
`Chr7:57749853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:57750076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:57750092`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B10,B83,C49,C53
`Chr7:57750092`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B10,B83,C49,C53
`Chr7:57750093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B105,B134,B18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775517.1

327 aa

164

327

RVT_2

PF07727 RVT_2 5-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775517.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	5	88	4.6e-16	59.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919534.1
ATGCGAAAGAATGGTAAGCTCATCTTGTTCCTAGTTTATGTTGATGATATTCTCATCACAGGAGAAGACTCCACTCTCATTACCCAAATCATTCACACACTCTCTCAAAAATTTGCTCTCAAAACCCTTGGCACAGTAAATTTCTTCCTAGGAATTCATGTCTTCAAAACATCTTCTCATTCATATCTCCTCAATCAATCCAAATACATAAATGACCTCCTCACCAAAACTAATCTTGCAGATTGCAAACCTCAACCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994491
ATGCGAAAGAATGGTAAGCTCATCTTGTTCCTAGTTTATGTTGATGATATTCTCATCACAGGAGAAGACTCCACTCTCATTACCCAAATCATTCACACACTCTCTCAAAAATTTGCTCTCAAAACCCTTGGCACAGTAAATTTCTTCCTAGGAATTCATGTCTTCAAAACATCTTCTCATTCATATCTCCTCAATCAATCCAAATACATAAATGACCTCCTCACCAAAACTAATCTTGCAGATTGCAAACCTCAACCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775517.1
MRKNGKLILFLVYVDDILITGEDSTLITQIIHTLSQKFALKTLGTVNFFLGIHVFKTSSHSYLLNQSKYINDLLTKTNLADCKPQPSPYDISSKLSLNDSPPFPNPTLYRSTVGALQYLTLTRPDIAFMVNKLSQYLQTPTENQWKACKRLLRYLKGTLHYSLTFSPSSYLHLKVFSDADWAGSIEDRKSTGGFFVFHGSNLLSWSSKKQNVVFRSSTESEYRSLANSSAEVTWIQSLLHELGFPIPHTPIIWCDNKSAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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