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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004558`

染色体: Chr07 坐标: 58305177-58312302 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004558`
名称	SmilChr07G004558
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58305177 - 58312302 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995147`
GeneID	`130995147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995147`
原始查询	`SmilChr07G004558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
Arabidopsis	`AT5G54700` (AT5G54700) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835559] identity=28.7; qcov=0.599; evalue=3.5e-14; confidence=low
Rice	`Os06g0295300` - identity=38.2; qcov=0.198; evalue=5.63e-13; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776278.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776278.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776278.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776278.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776278.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58305577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr7:58305589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr7:58305599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B119,B132,B14,B19,B24,B35,B51,B59,B69,B83,C26,C50,C56,C74,C87
`Chr7:58305609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr7:58305623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C18
`Chr7:58306987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:58307006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:58307011`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:58307011`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr7:58307044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B139
`Chr7:58307054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B89,C72,C78
`Chr7:58307146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776278.1

384 aa

192

384

Ank_2

Ank

Ank_4

PGG

PF12796 Ank_2 80-159 aa PF00023 Ank 104-124 aa PF13637 Ank_4 108-158 aa PF13962 PGG 210-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776278.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	80	159	9.7e-12	46.0	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057776278.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	104	124	1.9e-09	38.0	Ankyrin repeat
`XP_057776278.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	108	158	1.8e-11	44.7	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057776278.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	210	317	4.2e-20	72.4	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920295.1
AGAAAAAGAAAAAAGAATAAATTAAATAGAACCTTATCATCATGCCCTCAATTATGGCCTTATATATTGCCAGAGAAAGAAAGAAATGCATTTATAATTAGTGGGGAAGGAAGAATGGCTGCAGAACTCTACGATGCTGTATACAAAGGGGATGTAACAAAATTTCATAAACTAGTTGAACAAGATCCATATCTCGTTGAAACTGCTTCATTTTCATGTTCAAGAAATGTTCTTCACATCGGAACAATGCGGGGACAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995147
ATGTTCAAGAAATGTTCTTCACATCGGAACAATGCGGGGACAGACAGCCATGGTGGAAGAGGTGCTGAATATGAATCCGTGGCTTGCTCGGAGTTTAGACTCCCAACAACAGTCGCCTCTGCACATAGCAGCAGCAGAAGGGCGCTTCGAGATCTCGAGAAAATTGTTATCAGTAGCCCCGGAGACGCGCTGGTGGCGCGACTGTCGCGATATGAACCCGGTTCATATCGCGGCCTGAATGGGCATGTTGAGATGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776278.1
MFKKCSSHRNNAGTDSHGGRGAEYESVACSEFRLPTTVASAHSSSRRALRDLEKIVISSPGDALVARLSRYEPGSYRGLNGHVEMLEHLLEESRLPAMERVGRGQTVLHLCVKHGKLETLKVLVGKLWELVEAVDEDGETLLHLAVRSTQLETLQYLVQIMKIRSKPNSMGKTPAQILNRSPPAGTPHYSEMGRIIDTWFAPIVHYHEILPKMSDAVMVVAVLIATMAFQNAVNPPGGVWQDDTSSHKAGDAVIAYTHPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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