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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004578`

染色体: Chr07 坐标: 58569912-58570741 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004578`
名称	SmilChr07G004578
描述	uncharacterized SmilChr07G004578
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58569912 - 58570741 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995160`
GeneID	`130995160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995160`
原始查询	`SmilChr07G004578`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0294000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0294000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G11000` (AT4G11000) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826701] identity=34; qcov=0.739; evalue=2.47e-12; confidence=low
Rice	`Os06g0294000` - identity=27.4; qcov=0.862; evalue=1.01e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776292.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776292.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776292.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776292.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58569989`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B26
`Chr7:58569989`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B26
`Chr7:58570066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C58
`Chr7:58570067`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B5,C34,C57,C68
`Chr7:58570067`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B5,C34,C57,C68
`Chr7:58570070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr7:58570149`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A6,B117,B12,B127,B128,B30,B47,B48,B55,B84,C13,C18,C23,C28,C43,C87,D7,D9
`Chr7:58570151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B12,B55,C23
`Chr7:58570159`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B101,B125,C71
`Chr7:58570159`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B101,B125,C71
`Chr7:58570239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C16
`Chr7:58570267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776292.1

203 aa

102

203

PGG

PF13962 PGG 41-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776292.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	41	148	1.9e-24	86.4	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920309.1
TAAGATACTTGGTGCAAAGAACTAAGCTAGACAAGGAGATGACGAATTCATGGGCAAAACAGCGTTGGATATCTTGAAGGAGAGCCCTCGAGACCCAATCACCTATCCAGAAATCAGAAAGATCTTGAATAGTTTATCAAATCGTTCGAAATTGCTGGGAATCCTCCCCAAGATGACCGACATCACAATGGTGGTGGTCGTCCTCATCGCCACCATGGCGTTCCAATCCATCCTCCAACCCCCCGGCGGCGTGTGGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995160
ATGGGCAAAACAGCGTTGGATATCTTGAAGGAGAGCCCTCGAGACCCAATCACCTATCCAGAAATCAGAAAGATCTTGAATAGTTTATCAAATCGTTCGAAATTGCTGGGAATCCTCCCCAAGATGACCGACATCACAATGGTGGTGGTCGTCCTCATCGCCACCATGGCGTTCCAATCCATCCTCCAACCCCCCGGCGGCGTGTGGCAAGACGACACGTCAACGCACAAAGCCGGTGAAGCAGTGATGGCATACACACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776292.1
MGKTALDILKESPRDPITYPEIRKILNSLSNRSKLLGILPKMTDITMVVVVLIATMAFQSILQPPGGVWQDDTSTHKAGEAVMAYTHPKMYKHFVNANTTAFVSSLITIMLITTGLPLEHFFFLAVATTAMWLSLTSLAVGYGASLIMTTPNEEQTLGYIVAAVVCVFLSFILLLVLYLCINGLQSSWRRKSRYEYKRLRHLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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