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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004579`

染色体: Chr07 坐标: 58571145-58571516 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004579`
名称	SmilChr07G004579
描述	uncharacterized SmilChr07G004579
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58571145 - 58571516 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994516`
GeneID	`130994516`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994516`
原始查询	`SmilChr07G004579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994516

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775542.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775542.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775542.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775542.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58571179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A6,B128,D10,D7
`Chr7:58571231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	89	A14,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A4,A7,A9,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B114,B115,B117,B12,B120,B124,B13,B130,B134,B140,B17,B23,B26,B27,B29,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B49,B55,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B71,B73,B75,B76,B81,B86,B88,B93,B95,C1,C15,C19,C2,C21,C23,C28,C29,C31,C33,C34,C39,C44,C49,C5,C51,C52,C53,C60,C61,C7,C71,C73,C81,D1,D11,D2,D4,D5,D6,D8
`Chr7:58571255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr7:58571261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:58571267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C42,C49
`Chr7:58571279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B82,C27
`Chr7:58571431`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B101,B105,B129,B131,B97,B99,C10,C2,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775542.1

123 aa

123

RVT_3

PF13456 RVT_3 10-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775542.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	10	90	9.2e-14	52.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919559.1
ATGTTTAAAGGCGGCATTGGTTTTGCATTTGAAGCAGAGTTGTTAGCCATCATTACTGCCATCAACATTGCTCATGACCATGGTTGGATGCATCTTTGGGTTGAGGCCGACTCTATGTATGTCGTTCGCTTATTGGAGACTTGTTCCATGGATGTTCCTTGGCGCTTCATGGTGTCTTGGAAACATATTCTTCGTCTTCTCCCGGATTTTAAATTGATCGTCACTTACATTTATAGGGAGGGAAATATGCCAGCTGATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994516
ATGTTTAAAGGCGGCATTGGTTTTGCATTTGAAGCAGAGTTGTTAGCCATCATTACTGCCATCAACATTGCTCATGACCATGGTTGGATGCATCTTTGGGTTGAGGCCGACTCTATGTATGTCGTTCGCTTATTGGAGACTTGTTCCATGGATGTTCCTTGGCGCTTCATGGTGTCTTGGAAACATATTCTTCGTCTTCTCCCGGATTTTAAATTGATCGTCACTTACATTTATAGGGAGGGAAATATGCCAGCTGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775542.1
MFKGGIGFAFEAELLAIITAINIAHDHGWMHLWVEADSMYVVRLLETCSMDVPWRFMVSWKHILRLLPDFKLIVTYIYREGNMPADIMANGEKYEGWWPFAIKEIRQAVARDMSTHSHVRVVH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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