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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004592`

染色体: Chr07 坐标: 58719919-58721491 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004592`
名称	SmilChr07G004592
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58719919 - 58721491 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994521`
GeneID	`130994521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994521`
原始查询	`SmilChr07G004592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
Arabidopsis	`AT5G51160` (AT5G51160) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835190] identity=25.8; qcov=0.989; evalue=3.2e-27; confidence=low
Rice	`Os09g0334900` - identity=26.6; qcov=0.839; evalue=1.05e-25; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008157 (protein phosphatase 1 binding); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0035304 (GO:0035304)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775547.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775547.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775547.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775547.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58719923`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B78,C1,C82
`Chr7:58719923`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B78,C1,C82
`Chr7:58719924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C1,C82
`Chr7:58719927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:58719942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C1,C82
`Chr7:58719997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:58720027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:58720033`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,A21,A4,A5,B112,B136,B139,B16,B2,B31,B36,B65,B69,B73,B83,C1,C23,C29,C34,C47,C49,C58,C59,D8
`Chr7:58720045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:58720068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C1,C82,D10
`Chr7:58720100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:58720101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B135,B20,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775547.1

380 aa

190

380

Ank_2

Ank

Ank_4

Ank_2

Ank

Ank_4

Ank_2

PGG

PF12796 Ank_2 3-81 aa PF00023 Ank 28-46 aa PF13637 Ank_4 30-79 aa PF12796 Ank_2 56-121 aa PF00023 Ank 60-81 aa PF00023 Ank 94-125 aa PF13637 Ank_4 98-140 aa PF12796 Ank_2 98-165 aa PF13962 PGG 196-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	3	81	1.5e-28	99.9	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	28	46	4.5e-20	71.3	Ankyrin repeat
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	30	79	1.8e-16	60.5	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	56	121	1.5e-28	99.9	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	60	81	4.5e-20	71.3	Ankyrin repeat
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	94	125	4.5e-20	71.3	Ankyrin repeat
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	98	140	1.8e-16	60.5	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	98	165	1.5e-28	99.9	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775547.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	196	304	6.6e-20	71.8	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919564.1
ATGCACGGACAATCAGCCATCGTTGAAGAGGTGTTGAGGATGAATCCACGTCTAGCTCGGATTCCAGACTCCCAGAAATCATCGCCTCTCCACATCGCAGCAGCAGAAGGGCACGTCAAGATCGCCTCAGAACTGCTATCAGTTGCCCCGGAGATGTGCTGGTGGCGCGACGACCAAGGCATGAACCCGGTTCATGTTGCCGCCATGAACGGGCATGTCGAGTTAGTCGAGCATCTCCTTGGAGAGAGTTGTTTGCCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994521
ATGCACGGACAATCAGCCATCGTTGAAGAGGTGTTGAGGATGAATCCACGTCTAGCTCGGATTCCAGACTCCCAGAAATCATCGCCTCTCCACATCGCAGCAGCAGAAGGGCACGTCAAGATCGCCTCAGAACTGCTATCAGTTGCCCCGGAGATGTGCTGGTGGCGCGACGACCAAGGCATGAACCCGGTTCATGTTGCCGCCATGAACGGGCATGTCGAGTTAGTCGAGCATCTCCTTGGAGAGAGTTGTTTGCCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775547.1
MHGQSAIVEEVLRMNPRLARIPDSQKSSPLHIAAAEGHVKIASELLSVAPEMCWWRDDQGMNPVHVAAMNGHVELVEHLLGESCLPAMDRLHRGQTVLHLCVKHGQFRALKVLVEKLGELVCAKDDDGETVLHLAVRCNQTIQYLVDNKTVERQTRNSMGKTALQVLNESLPHTATYTKIKRILINLSNESYFEVLHKMTDVTMVVVILIATMAFQAAMSPPGGMWEHETLSHRAGEAVLASTNPTMYRHLVRANTTAFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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