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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004607`

染色体: Chr07 坐标: 58860787-58864119 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004607`
名称	SmilChr07G004607
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58860787 - 58864119 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995174`
GeneID	`130995174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995174`
原始查询	`SmilChr07G004607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.6; qcov=0.968; evalue=2.69e-56; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.8; qcov=0.862; evalue=1.62e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057776309.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776309.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776309.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776309.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58860970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:58861008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B113
`Chr7:58861053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:58861106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B53,D5
`Chr7:58861119`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A10,A14,A6,B101,B127,B138,B22,B47,B53,B67,B76,B8,B87,C15,C25,C31,C36,C60,C72,C75,C9,D1,D5
`Chr7:58861120`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A10,A14,A6,A7,B101,B127,B138,B14,B22,B47,B53,B67,B72,B76,B8,B87,C15,C25,C31,C36,C51,C60,C72,C75,C9,D1,D5
`Chr7:58861124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B56,C8
`Chr7:58861142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B102,B38,C37,C64
`Chr7:58861170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr7:58861183`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A15,A7,A8,B106,B110,B126,B129,B132,B135,B20,B21,B49,B51,B57,B66,B76,B94,C37,C49,D10,D2
`Chr7:58861186`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A15,A7,A8,B106,B110,B126,B129,B132,B135,B20,B21,B49,B51,B57,B66,B76,C37,C49,D10,D2
`Chr7:58861201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B78,C41,C50,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776309.1

846 aa

423

846

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 73-249 aa PF23559 WHD_DRP 335-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776309.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	73	249	1.7e-38	132.6	NB-ARC domain
`XP_057776309.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	335	405	1.9e-14	54.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920326.1
ATTTTAAGAGCAACGTGCTTATTCAGACAACTGCAGCAAATTTAAATGAATGCTGCACATGGCTTCTTCATTTTTCTGATAAAAAGAATTTCATTATCATGTGTAGATATCCAATTAATTTTCCAATCGGCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGCTAAATCTCTCACTGAAATTGTTACCTTCTTGCAGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTCGATCACCATGAAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995174
ATGTCCAATTTTATAACCTTGCTTCGAGCTCTGTGCAAATGCGCAACTGTTGAGGAGGACTTGTATCACGATCTACAACAAGTGATAGAAGAAATGAATTTGATCATGAAGGAAGCCATGGAGATTACAGCCGCAGCTCAACTGCAGAGAAAGGTCTCCTCAACTCATGCTGCCTCCCCTTCCCCTGTGAAGGACAGCATAATGGTGGGCTTCGACAAGGTGGTACTTGAAGTGCTGGATAAGCTCACCGGAGTTCAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776309.1
MSNFITLLRALCKCATVEEDLYHDLQQVIEEMNLIMKEAMEITAAAQLQRKVSSTHAASPSPVKDSIMVGFDKVVLEVLDKLTGVQGSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHVFQHALVKEHFDICAWTTISQTYNVRETIREVLFQASGDPDCDLGENQLGQKSLISEDELGLKLHKYLWGRRYLIIMDDMWSIEVWDKIRSFFPDCNDGSRIIVTTRLSNLTSQLGESYGVGMKFLDEASSWDLFCKTVFGGKSFPHELEDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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