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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004622`

染色体: Chr07 坐标: 59032427-59033706 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004622`
名称	SmilChr07G004622
描述	protein BIG GRAIN 1-like B
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59032427 - 59033706 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995210`
GeneID	`130995210`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995210`
原始查询	`SmilChr07G004622`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BIG GRAIN 1-like B
产物	protein BIG GRAIN 1-like B
Arabidopsis	`AT1G54200` (AT1G54200) DNA mismatch repair Msh6-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841860] identity=31.2; qcov=0.575; evalue=5.11e-16; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF30505 (Big_grain_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995210

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776350.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057776350.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776350.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776350.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776350.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59032557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C43,C65
`Chr7:59032558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C26,C56,C87,D5
`Chr7:59032615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,D3
`Chr7:59032657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr7:59032666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:59032768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,C21,C7,D1
`Chr7:59032786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr7:59032905`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B124,B14,B17,B56,B7,B85,C42,C44,D10
`Chr7:59032954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr7:59033062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B66
`Chr7:59033068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:59033089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776350.1

334 aa

167

334

Big_grain_1

PF30505 Big_grain_1 15-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776350.1`	Pfam	`PF30505`	Big_grain_1	Domain	15	195	7.5e-15	56.1	BIG GRAIN 1 auxin transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920367.1
TTTAGTGTCGCCTTAAATCCAGCCCCTTTTTCATTCCTTTTATATCCTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCATTCAACTCCATATTAGTATTTCTCTCTCCCTCTCTAAAAACTCACAGAATGTCTTCATCGAGAGAGAAACAATGGAGACAAGAAAATCCGAAACCCAAGAAATCCCACCGCAACACCCCCTCATTCTCCTCCTCCCTCCTCGACGAAATCTGCCGCTCCATCGACGAGAAGCCAGAGCCCCAAACGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995210
ATGTCTTCATCGAGAGAGAAACAATGGAGACAAGAAAATCCGAAACCCAAGAAATCCCACCGCAACACCCCCTCATTCTCCTCCTCCCTCCTCGACGAAATCTGCCGCTCCATCGACGAGAAGCCAGAGCCCCAAACGGCGCCGTTTTCGAGGGTCGAGAAATGGATGGAAAGCGACAAAACCGTATCCCGCCGCCGCCCGAGATTCGACAACGCCGTCTTCCCCGACAACGACCCCCCCTTCCTCTCCACCTCAGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776350.1
MSSSREKQWRQENPKPKKSHRNTPSFSSSLLDEICRSIDEKPEPQTAPFSRVEKWMESDKTVSRRRPRFDNAVFPDNDPPFLSTSASSANRPKPVRTARDKDCYLFDEYEEHERKIAAAAAAAGGRDDLIKSKSRAMRIYANLKKMKQPVSPGARLTTFFSSIFAGLNRKKSNRNNAAAESPAKMLARCSTKSSDNTRRDGIEIRNARSDLARAVADRGTMPRGQESLGGDGRPPLPPNVFRNFKKCDSNKLRCYESDED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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