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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004627`

染色体: Chr07 坐标: 59109687-59116652 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004627`
名称	SmilChr07G004627
描述	F-box/LRR-repeat protein 15-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59109687 - 59116652 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995187`
GeneID	`130995187`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995187`
原始查询	`SmilChr07G004627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein 15-like
产物	F-box/LRR-repeat protein 15-like
Arabidopsis	`AT4G33210` (SLOMO) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829457] identity=71.7; qcov=0.797; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0396400` (OsFbox552) - identity=62.2; qcov=0.647; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995187

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776322.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776322.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776322.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776322.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776322.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59110363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B88,B99
`Chr7:59110643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr7:59110747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr7:59111168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:59111180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr7:59111194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:59112575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:59112661`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B45,C2
`Chr7:59112661`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B45,C2
`Chr7:59112706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,D11,D8
`Chr7:59112713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B126,C55
`Chr7:59112735`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A9,B126,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776322.1

1003 aa

502

1003

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 205-244 aa PF12937 F-box-like 208-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776322.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	205	244	3.9e-10	39.9	F-box domain
`XP_057776322.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	208	248	5e-11	42.9	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920339.1
TTTACGTTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGAGAGAGGAGCAGAGAACAGAACTGAGAGAAATTGTAGAAGGAAAAGGGAGAAATTATCCCCATTTTTGGCCCTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTGCTCGCAAAGATGGAACTTGTATATTGAAACTAACTTCGTTCGATCCGATCCATTTTGGATGTGCATGCAGTATGTAGATTGTTGTTGTTTTTGTAATTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995187
ATGAGGATTTGCTGTTTCCCTTTTCTATGCTTTGGAGAAGGAGAAAAAGATAACAATACGAATTCACATTATTCTGTTGAGGGGAAAGATAACATGGAGGAAGGCGATTTGGGGAAAGAGAGCGATGGATTTAAGAATCATCGTTTCAGATTAGTTTTGAAGGAAGATACCAACAATGTTGTTGGTGTTGAAGGGGAGGAGATGGAGGTACAGTGGAAATTAAAACTAGCGATCTCAAAGGAGAAAAAACAGATGTTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776322.1
MRICCFPFLCFGEGEKDNNTNSHYSVEGKDNMEEGDLGKESDGFKNHRFRLVLKEDTNNVVGVEGEEMEVQWKLKLAISKEKKQMFRFEFDEKDVDFLKYTSDGRGSEGMRGDVNSNVGLVGGPSSSSMVPPGRGNPMYDSQNKRAKVQSLDPNWRHDNEKGIHYITPVHEVSYHDVGDSGVSGDHDSNKNDNLGSGDLSEFRIDLTDDLLHMVLSFLNHVDLCRAALVCRQWRDATSHEDFWRYLNFENRPISEEQFED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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