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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004633`

染色体: Chr07 坐标: 59167881-59169326 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004633`
名称	SmilChr07G004633
描述	uncharacterized SmilChr07G004633
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59167881 - 59169326 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994528`
GeneID	`130994528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994528`
原始查询	`SmilChr07G004633`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=37.8; qcov=1.05; evalue=5e-106; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775556.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775556.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775556.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775556.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59167915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B31,C80,D11,D6
`Chr7:59167942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:59167955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr7:59167990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B135,B66
`Chr7:59168002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B24,B53,D5
`Chr7:59168003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C25,C61
`Chr7:59168030`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A2,B126
`Chr7:59168030`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A2,B126
`Chr7:59168045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B2,C12
`Chr7:59168060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C39,C50
`Chr7:59168084`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr7:59168084`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775556.1

481 aa

240

481

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 3-75 aa PF02992 Transposase_21 275-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775556.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	75	1.1e-21	77.5	Transposase-associated domain
`XP_057775556.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	275	481	6.7e-93	310.5	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919573.1
ATGGATAAATTATGGATGTCAAAGAATAGATTATCGGAAGAGTATGAAGGTGGAGTTGATGCCTTCTTGAAGTTCGCAGTGGAGAGAGGTTGCGATTCCAACTTCATGTCTTGTCCTTGTACGAAGTGTGCTAACACTAGGAAGCACAAACTTAGTATTGTAAAGGGACATATCATAATGAATGGTATGGACATGACTTATAAGCGGTGGATATGGCACGGGGAAGGGCTTACATCATCACAATCAACATATGAATCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994528
ATGGATAAATTATGGATGTCAAAGAATAGATTATCGGAAGAGTATGAAGGTGGAGTTGATGCCTTCTTGAAGTTCGCAGTGGAGAGAGGTTGCGATTCCAACTTCATGTCTTGTCCTTGTACGAAGTGTGCTAACACTAGGAAGCACAAACTTAGTATTGTAAAGGGACATATCATAATGAATGGTATGGACATGACTTATAAGCGGTGGATATGGCACGGGGAAGGGCTTACATCATCACAATCAACATATGAATCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775556.1
MDKLWMSKNRLSEEYEGGVDAFLKFAVERGCDSNFMSCPCTKCANTRKHKLSIVKGHIIMNGMDMTYKRWIWHGEGLTSSQSTYESSWVGKGDTSYNVEEPISMIHDAYDAYEDNPTHFQTLLEDAERDLYNGCTNFTKLSATIKLYNLKAKYGWSDTSFKDLLKLLKDMLPEGNLLPESLYAAKKTLSTLGLDYKKIHACPNDCILYRKEFKDANDCPTCGMSRWKTNTKTKGVSRVPSKVLWYFPPIPRFRRMFRTPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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