当前解析结果
SmilChr07G004641| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004641 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004641 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004641 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 59269918 - 59270916 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994531 |
|---|---|
| GeneID | 130994531 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994531 |
| 原始查询 | SmilChr07G004641 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994531 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057775558.1 |
| 2 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057775558.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775558.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775558.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775558.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:59270291 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B82,C24 |
Chr7:59270296 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B32,B82 |
Chr7:59270296 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B32,B82 |
Chr7:59270300 |
C |
CCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 15 | B117,B4,B50,B56,B64,B65,B70,B75,B76,B81,B96,C33,C51,C52,C7 |
Chr7:59270306 |
TAA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B111 |
Chr7:59270306 |
TAA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr7:59270314 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B122,B127,C46 |
Chr7:59270331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr7:59270376 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B91,D10 |
Chr7:59270378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:59270522 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 17 | B10,B119,B129,B20,B35,B45,B50,B57,B62,B66,B68,B72,B81,C11,C48,C67,C86 |
Chr7:59270527 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A14,A21,A23,A24,B10,B107,B111,B112,B114,B137,B17,B23,B34,B46,B47,B57,B66,B68,B80,B81,B87,B91,C25,C35,C49,C67,C7,C83,C86,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。