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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004643`

染色体: Chr07 坐标: 59279017-59281230 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004643`
名称	SmilChr07G004643
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59279017 - 59281230 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995197`
GeneID	`130995197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995197`
原始查询	`SmilChr07G004643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT5G11290` (AT5G11290) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831000] identity=32; qcov=0.995; evalue=8.12e-70; confidence=low
Rice	`Os01g0562600` - identity=31.5; qcov=0.974; evalue=1.42e-63; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776335.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776335.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776335.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776335.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59279246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:59279273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:59279274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B108,B3,B72,C18
`Chr7:59279282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C11,C69
`Chr7:59279287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C85
`Chr7:59279290`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A2,A20,B113,B122,B138,B55,B9,C60,C72,C82
`Chr7:59279294`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A2,A20,B113,B122,B138,B55,B9,C60,C72,C82
`Chr7:59279324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A21,A25,B110,B123,B131,B41,B51,B52,B54,B59,C22,C4,C74,C85
`Chr7:59279358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C11
`Chr7:59279360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:59279390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B44,B76,B99,C38
`Chr7:59279435`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A21,A24,B130,B131,B23,B25,B41,B42,B92,B94,C21,C3,C36,C6,C80,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776335.1

429 aa

214

429

DUF247

PF03140 DUF247 34-416 aa

XP_057776337.1

424 aa

212

424

DUF247

PF03140 DUF247 29-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776335.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	34	416	1.2e-119	401.0	Plant protein of unknown function
`XP_057776337.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	29	411	1.1e-119	401.1	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920354.1
GTGTTTCATTATTGGTCTTCAAAGTAAAAGAAAATCTGCGTTTCATTATTGAATCAGCACCTTCCCAAATAGCATTTAAGTTATATTGAGTGTATATTCCCCTGAAGATATATTACTTGCTCTCGAAACCAACCAGCAGCTGCTTACTGCTTAGTACTACTTCATCCACTGCCAATCATGCTCAACACAACGCAAGCCTGCTGCGCTAACTTGAATGAAAAACTGACGAAACTCGGCGCGGAGGCAAAATCAGAATGCAC...

XM_057920352.1
GTGTTTCATTATTGGTCTTCAAAGTAAAAGAAAATCTGCGTTTCATTATTGAATCAGCACCTTCCCAAATAGCATTTAAGTTATATTGAGTGTATATTCCCCTGAAGATATATTACTTGCTCTCGAAACCAACCAGCAGCTGCTTACTGCTTAGTACTACTTCATCCACTGCCAATCATGCTCAAAAATTTCTTAACGTTATATGATATATATGGATCCTAACAGCACAACGCAAGCCTGCTGCGCTAACTTGAATGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995197
ATGCTCAACACAACGCAAGCCTGCTGCGCTAACTTGAATGAAAAACTGACGAAACTCGGCGCGGAGGCAAAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATAAACATTTACGGAACGTCAACCCCAATGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATCGGCCCTTATCACCGCAACAAGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATCACAAGCTACGTTACTTCCAGCACCTCATCATAAGGAAACCTTCCAACAATGTGGAAAGGTA...

LOC130995197
ATGATATATATGGATCCTAACAGCACAACGCAAGCCTGCTGCGCTAACTTGAATGAAAAACTGACGAAACTCGGCGCGGAGGCAAAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATAAACATTTACGGAACGTCAACCCCAATGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATCGGCCCTTATCACCGCAACAAGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATCACAAGCTACGTTACTTCCAGCACCTCATCATAAGGAAACCTTCCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776335.1
MIYMDPNSTTQACCANLNEKLTKLGAEAKSECTIYRVHKHLRNVNPNAYEPEVIAIGPYHRNKDHLKMMEDHKLRYFQHLIIRKPSNNVERYAACVGKWEAEARKCYADEPTSLSPSDFIQMLVLDGCFILELLLKYVVESEREENDPIFQMGWMMYSLHRDLMLFENQLPFFVLCELFDLIEAPGQHSRLLDLLGLFFHGLYPGEGYRGEVSVAPRDVKHLLHFIHRNWLPRGTGTGGRKKQDKGLYFINSAARLKEAN...

XP_057776337.1
MLNTTQACCANLNEKLTKLGAEAKSECTIYRVHKHLRNVNPNAYEPEVIAIGPYHRNKDHLKMMEDHKLRYFQHLIIRKPSNNVERYAACVGKWEAEARKCYADEPTSLSPSDFIQMLVLDGCFILELLLKYVVESEREENDPIFQMGWMMYSLHRDLMLFENQLPFFVLCELFDLIEAPGQHSRLLDLLGLFFHGLYPGEGYRGEVSVAPRDVKHLLHFIHRNWLPRGTGTGGRKKQDKGLYFINSAARLKEANIRFKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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