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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004651`

染色体: Chr07 坐标: 59326854-59336179 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004651`
名称	SmilChr07G004651
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59326854 - 59336179 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995201`
GeneID	`130995201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995201`
原始查询	`SmilChr07G004651`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT2G36430` (AT2G36430) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818217] identity=34.5; qcov=0.937; evalue=7.7e-69; confidence=low
Rice	`Os01g0562600` - identity=32.6; qcov=0.947; evalue=6.11e-65; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776341.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776341.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057776341.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776341.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776341.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59327048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:59327073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B55
`Chr7:59327075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B22,B23,B55,C80
`Chr7:59327085`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A24,B23,C80
`Chr7:59327085`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A24,B23,C80
`Chr7:59327096`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B16,B22,B55
`Chr7:59327096`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B16,B22,B55
`Chr7:59327127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B80,C46
`Chr7:59327164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B91,D10,D6
`Chr7:59327167`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C78
`Chr7:59327167`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C78
`Chr7:59327168`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776341.1

414 aa

207

414

DUF247

PF03140 DUF247 30-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776341.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	30	403	4.3e-116	389.3	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920358.1
TATTGTTCTTCAAAGAAAAAGAAAATCTGTGTTTCATTATTGAATCAGCACCTTCCCAAACAACATTTAAGTTATATTGAGTGTATATTCCCTTGAAGATATATTACTTGCTCTCGAAACCAACCAGCAGCTGCTTACTGCTTAGTACTACTTCATCCATTGCCAATCATGTTCAAAAATTTCTCAACGTTATATCATATATATGGATCCTAACAGCACAATGCAAGCCTGCGCTAGCTTGAATGAAAAACAGACGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995201
ATGGATCCTAACAGCACAATGCAAGCCTGCGCTAGCTTGAATGAAAAACAGACGAAACTCGGCGCGGAGGCAAAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATGAACATTTACGGAACGTGAACCCCATTGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATTGGCCCTTATCACCGCAACAAGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATTACAAGCTACGTTACCTCCAGCAGCTCATCATAAGGAAACCTTCCAACAATGTGGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776341.1
MDPNSTMQACASLNEKQTKLGAEAKSECTIYRVHEHLRNVNPIAYEPEVIAIGPYHRNKDHLKMMEDYKLRYLQQLIIRKPSNNVESYVECVGRLEAEARKCYADEPTSMSPSDFIQMLVLDGCFILELLRKYGMVFLREKNDPIFTMKWMIISLQRDLMLFENQLPFFVLCELFDLIEAPGQHSRLRDLLGLFFCGLYPGNGYRGEESVAPREVKHLLHFIHRNWLPRGTGAGGRKEQDKGLQFIDSATRLKEANVRFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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