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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004655`

染色体: Chr07 坐标: 59422563-59425610 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004655`
名称	SmilChr07G004655
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59422563 - 59425610 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995198`
GeneID	`130995198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995198`
原始查询	`SmilChr07G004655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT4G31980` (AT4G31980) PPPDE thiol peptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829328] identity=35.1; qcov=0.991; evalue=3.63e-72; confidence=medium
Rice	`Os05g0242000` - identity=32.6; qcov=0.993; evalue=1.1e-63; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776338.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776338.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776338.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776338.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59422712`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A1
`Chr7:59422712`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A1
`Chr7:59422722`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A1
`Chr7:59422722`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A1
`Chr7:59422727`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr7:59422727`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:59422754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B112,C14,C25,C58
`Chr7:59422798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B34,C5
`Chr7:59422813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C51
`Chr7:59422839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B122,C30
`Chr7:59422843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B113,B123,B60,C85
`Chr7:59422863`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A8,B127,B132,B140,B3,B6,B9,C11,C38,C67,C69,C71,C8,D1,D2,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776338.1

423 aa

212

423

DUF247

PF03140 DUF247 29-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776338.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	29	410	1e-120	404.5	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920355.1
AAGTTGAATTTTATGAAGATGAGTTGTGAAATGCAAACCACACAATACATGTATATATACATAATATCTGTGTTTCATTTCTTCAAAGAAAAAGAAAATCTGTGTTTCATTATTGAATCAGCTCCTTCCCAAACAACATGTAAGTTATATTGAGTGTATATTCCCCTGAAGATATATTACTTGCTCTCGAAACCAACCAGCAGCTGCTTACTGCTTAGTACTACTTCTTCCACTGCCAATCATGCTCATAACAACGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995198
ATGCTCATAACAACGCAAGCCTGCTGCGCTAGCTTGAATGAAAAACTGACGAAACTGAGCACGGGGGCAGAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATGAACATTTACGGAACGTGAACCCCATTGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATTGGCCCTTATCACCGCAACAAGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATCACAAGCTACGTTACTTCCAGCACCTCATCAGAAGGAAACCTTCCAACAATGTGGAAAGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776338.1
MLITTQACCASLNEKLTKLSTGAESECTIYRVHEHLRNVNPIAYEPEVIAIGPYHRNKDHLKMMEDHKLRYFQHLIRRKPSNNVESYAACVGRLEAEARKCYADEPTSLSPSEFIQMLVLDGCFIVELLLKRDMVSLREKNDPIFQMDWIVTSLQRDLMLFENQLPLFVLCELFDLIEDPGQHSRLQDLLVQFFSIMCDGEGYRGQASIAPRKVKHLLHFIHRSWLPRGTGTGGRKKQDKGLQFINSAARLKEANVRFEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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