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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004670`

染色体: Chr07 坐标: 59619483-59624753 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004670`
名称	SmilChr07G004670
描述	uncharacterized SmilChr07G004670
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59619483 - 59624753 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995241`
GeneID	`130995241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995241`
原始查询	`SmilChr07G004670`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AFG1-like ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817091]; symbol=AT2G25530; hit=AT2G25530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AFG1-like ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817091]; symbol=AT2G25530; hit=AT2G25530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25530` (AT2G25530) AFG1-like ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817091] identity=67.2; qcov=0.926; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0851900` - identity=66.4; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF03969 (AFG1_ATPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776434.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057776434.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057776434.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057776434.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776434.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59620388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,C1,C7,D8
`Chr7:59620403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:59620404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:59620632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:59620856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B47,C2
`Chr7:59621066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C16
`Chr7:59621205`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B27,B57
`Chr7:59621205`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B27,B57
`Chr7:59621235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:59621251`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,B13
`Chr7:59621251`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B111,B13
`Chr7:59621258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776434.1

595 aa

298

595

AFG1_ATPase

PF03969 AFG1_ATPase 157-499 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776434.1`	Pfam	`PF03969`	AFG1_ATPase	Family	157	499	9.5e-68	229.5	AFG1-like ATPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920451.1
GAGAGAGAGTGAGATGTGTCGTTAATGGTGAAGTTGCGGCTGAAGCGGAAGCCACGTCAGTGAGTCCTGCTGCTTTTGGACAACTTTCGACAAACATAACTACTCACATCGCCGCTTCTTAACTAACACCTCAATCAAACCAAACATTCATTCACACAAAATTCCTTCTCCAAAATAATTCCCTTTGATCTCAACGAGAAATAGGAATAAAAAACGCCATAGATTAGATTAGCTAGAAAAGGTTCGAATTGGGAGAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995241
ATGAAGAAACTCTTGATGTCTGTTTCGTCTAAATTCTCTTACCAACCCTCCAAAATTCGTGTTGCTCAATTCAGGTTTTACTGCGATCGCCCACCTTCTTCTCTCTCCAACCACCCTGGGCCGCTTGCTTATTATAAGAGTCTCGTTAATCAAGGGAAGTTGAAACATGATTCTTATCAGGAAAAGGTTGCTTTTCAGCTGGAGAATTTGCTCGGGAGGCTCGACCAGTATGAGAAAGATATGGAGGAATACCACGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776434.1
MKKLLMSVSSKFSYQPSKIRVAQFRFYCDRPPSSLSNHPGPLAYYKSLVNQGKLKHDSYQEKVAFQLENLLGRLDQYEKDMEEYHVNLAKWEENRENERRRLLLEEAKTKQQGGASSSMSRRRKFLNKWLSRNPDSVEPGVGKWVSYLNREKKLDLMVGQRPTAPPAPKGLYIYGNVGSGKTMLMDMFYGATEGIVQHRTRLHFHEAMLQIHDLMHKVWKSRKTEESFQSSISNWVMSLPFDTKVKEWLVEEEKYKQEMN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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