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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004671`

染色体: Chr07 坐标: 59643571-59644785 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004671`
名称	SmilChr07G004671
描述	agglutinin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59643571 - 59644785 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994538`
GeneID	`130994538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994538`
原始查询	`SmilChr07G004671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agglutinin-like
产物	agglutinin-like
Arabidopsis	`AT1G19715` (AT1G19715) Mannose-binding lectin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838560] identity=32.4; qcov=0.907; evalue=7.77e-33; confidence=low
Rice	`Os05g0508400` - identity=34.7; qcov=0.863; evalue=4.95e-34; confidence=low
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01419 (Jacalin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775563.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775563.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775563.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775563.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59643609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B99,C23
`Chr7:59643625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,B69,C83,D11
`Chr7:59643772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B104,B53,C46,D4
`Chr7:59643919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B52,C43
`Chr7:59643924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C36,C6
`Chr7:59643936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C36,C6
`Chr7:59644066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C39
`Chr7:59644090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:59644117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B70,B86,C64,C66
`Chr7:59644227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C36,C6
`Chr7:59644320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:59644345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775563.1

344 aa

172

344

Jacalin

PF01419 Jacalin 25-160 aa PF01419 Jacalin 192-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775563.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	25	160	1.6e-56	191.1	Jacalin-like lectin domain
`XP_057775563.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	192	340	1.6e-56	191.1	Jacalin-like lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919580.1
ATGCATACATATTCAACTAAACTTGGAGAATTTGTGCAGGAAAAAGAGTGCAGTTGTGTGGGAGAGATCGCTTTGGGGCCATGGGGATGCCACTCCGACACGGCCCGTCAATGGAGCTACAAACCAGAAGGAGGCGCTATCAAAAAAATTATCATTGGCTGCGGTTGGATAATCGATTCCCTTATGTTTAAGGCCGACGATTACTCCGCCAAATTCGGCGGCCACGGTGGTGACGCATTCCCTCGTATCAGAATCGATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994538
ATGCATACATATTCAACTAAACTTGGAGAATTTGTGCAGGAAAAAGAGTGCAGTTGTGTGGGAGAGATCGCTTTGGGGCCATGGGGATGCCACTCCGACACGGCCCGTCAATGGAGCTACAAACCAGAAGGAGGCGCTATCAAAAAAATTATCATTGGCTGCGGTTGGATAATCGATTCCCTTATGTTTAAGGCCGACGATTACTCCGCCAAATTCGGCGGCCACGGTGGTGACGCATTCCCTCGTATCAGAATCGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775563.1
MHTYSTKLGEFVQEKECSCVGEIALGPWGCHSDTARQWSYKPEGGAIKKIIIGCGWIIDSLMFKADDYSAKFGGHGGDAFPRIRIDYPSEFLIGISGTFGKVEHMEPDNVCTLTFHTNKNQYGPFGTKPGPTPFSLIANGAAVTGFHGRCGQYVEAIGLYVKPLSIQLKKQPSENASSCVPRFLLPPRSAAAMGGSGGRDWDDGVFAAVKGVHACVRVDTGALSAVRFSYLKSDGSAFLSPFHGGYCEGDVHLKEFSISK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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