当前解析结果
SmilChr07G004679| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004679 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004679 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004679 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 59740877 - 59745768 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995246 |
|---|---|
| GeneID | 130995246 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995246 |
| 原始查询 | SmilChr07G004679 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak |
| 产物 | K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT1G31150 (AT1G31150)K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=24.9; qcov=0.262; evalue=4.79e-12; confidence=weak |
| Rice | -- |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995246 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776443.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776443.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776443.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776443.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057776443.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:59741942 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B78,B82,C4 |
Chr7:59742674 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,C45,C87 |
Chr7:59743481 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776443.1PF09331
DUF1985 71-191 aa
PF02902
Peptidase_C48 748-864 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776443.1 |
Pfam | PF09331 |
DUF1985 | Family | 71 | 191 | 8.6e-12 | 45.9 | Domain of unknown function (DUF1985) |
XP_057776443.1 |
Pfam | PF02902 |
Peptidase_C48 | Domain | 748 | 864 | 7.4e-14 | 52.8 | Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。