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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004681`

染色体: Chr07 坐标: 59762312-59777054 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004681`
名称	SmilChr07G004681
描述	uncharacterized SmilChr07G004681
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59762312 - 59777054 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994542`
GeneID	`130994542`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994542`
原始查询	`SmilChr07G004681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0486300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0486300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G65230` (MYB53) myb domain protein 53 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836648] identity=87.5; qcov=0.169; evalue=1.16e-18; confidence=weak
Rice	`Os08g0486300` - identity=90; qcov=0.169; evalue=6.26e-19; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994542

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775568.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057775568.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775568.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775568.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59762380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:59762382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr7:59762386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:59762387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B1,B108,B13,B88
`Chr7:59762408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C85
`Chr7:59762408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:59762423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C70
`Chr7:59762444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A20,B74,C10
`Chr7:59762444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B74,C10
`Chr7:59767315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:59767366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B37,C77
`Chr7:59767466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775568.1

236 aa

118

236

Myb_DNA-bind_6

PF13921 Myb_DNA-bind_6 194-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775568.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	194	221	1e-06	29.6	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919585.1
ATGAACTGTCGAGCAAGGCGAGCAATAGTTCAAATTGAACTATTGCTCGACATCGAGTGTCGAGCATCGCGTGTCGAGCAACTTAGAACTGTCGAGCGAGGCAAAAGCGTCGAGCGTCAAGCATTGAACTGTCGAGCACAATTCACTCGTTGGGGAAATGCTCCTCGAGGGCCGTATATACGTCCGGGAGACCTTGCTCGAGTCGGAGTACCTTCGCCCGACGAACTATTGGACCCACTTCCGGAGCCGACTCCACCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994542
ATGAACTGTCGAGCAAGGCGAGCAATAGTTCAAATTGAACTATTGCTCGACATCGAGTGTCGAGCATCGCGTGTCGAGCAACTTAGAACTGTCGAGCGAGGCAAAAGCGTCGAGCGTCAAGCATTGAACTGTCGAGCACAATTCACTCGTTGGGGAAATGCTCCTCGAGGGCCGTATATACGTCCGGGAGACCTTGCTCGAGTCGGAGTACCTTCGCCCGACGAACTATTGGACCCACTTCCGGAGCCGACTCCACCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775568.1
MNCRARRAIVQIELLLDIECRASRVEQLRTVERGKSVERQALNCRAQFTRWGNAPRGPYIRPGDLARVGVPSPDELLDPLPEPTPPAAPILGQTRRHDAEAGPSRPQAYRDFPPGTGSVPLVCEPPLSSRQLSKAEIAAAMVDVDRVLADTMDFLNKGKAPAMDDRPTLRVTLKMIRSAIIGQAAGEGGGLKCGKSCRLRWINYLRPDIKRGKFSQEEEQTILNLHAILGNNAIFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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