Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004702`

染色体: Chr07 坐标: 59914360-59918585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004702`
名称	SmilChr07G004702
描述	UDP-N-acetylglucosamine transporter UGNT1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59914360 - 59918585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995270`
GeneID	`130995270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995270`
原始查询	`SmilChr07G004702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-N-acetylglucosamine transporter UGNT1-like
产物	UDP-N-acetylglucosamine transporter UGNT1-like
Arabidopsis	`AT4G32272` (AT4G32272) Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008177] identity=69.7; qcov=1.01; evalue=1.88e-176; confidence=high
Rice	`Os02g0614100` (BC14) - identity=71.2; qcov=0.936; evalue=9.01e-165; confidence=high
GO	GO:0005457 (GDP-fucose transmembrane transporter activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015297 (antiporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03151 (TPT); PF08449 (UAA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057776483.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776483.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776483.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776483.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59914692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B25,C35
`Chr7:59914708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C20,C34,C56
`Chr7:59916135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:59916192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C28,D10
`Chr7:59916501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:59917290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr7:59917808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C28
`Chr7:59917856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776483.1

342 aa

171

342

TPT

UAA

PF03151 TPT 45-334 aa PF08449 UAA 45-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776483.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	45	334	5.4e-13	49.7	Triose-phosphate Transporter family
`XP_057776483.1`	Pfam	`PF08449`	UAA	Family	45	337	9.3e-08	32.3	UAA transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920500.1
ATACAATAAGCTACTTCATGAGTAGTATAGGAATACAGATAAAATAAAAAATTATAGAGCCCTCTTCTAAATTTCTGAAAGCTTTCTAATTTTATATTAATTCGAACACATAATCTTTATATATGAATTAATACTAATTTTATTGACAATTAAAAACCGAAGAGTGATGAGCGTGTTGAAGAAAAATACTAAACAGAAAGAGAAAGTATTCCACTGAAAAAACAAATTAAAACGAGTTATTATAAGATCGTTTTGGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995270
ATGGCTACGAAAGCTAAGAGCAGTTCGATTCTACCAATGGCGTCGGACGATCCTCCGCCGAGAGTGGAGGAGAAGCTCTTCAAAGGATCCGCCATGACTAAACGCGGAGCTTATGCCGCCATCTCTTACATGACTTGCGCTGTGCTCTTGGTATTATTTAATAAAGCAGCTCTTTCTTCATACAACTTCCCATGTGCCAACGTCATTACACTTTGTCAGATGATATCTTCATGTTGTTTGCTATATGTTCTACGACGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776483.1
MATKAKSSSILPMASDDPPPRVEEKLFKGSAMTKRGAYAAISYMTCAVLLVLFNKAALSSYNFPCANVITLCQMISSCCLLYVLRRSKLISFNANESATVSDSSNTLVSIQTLIRTSPLALTYLLYMLVTMESVRGVNVPMYTTLRRTTVVFTMIVEYLLVRQKYTRPILGSVTLIVLGAFIAGSRDLSFDSYGYLVVFLSNFTTAIYLATIARIGKSSGLNSFGLMWCNGILCGPVLLLWTLFRGDLEMTMNFPYLLSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器