当前解析结果
SmilChr07G004704| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004704 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004704 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004704 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 59920779 - 59923438 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995271 |
|---|---|
| GeneID | 130995271 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995271 |
| 原始查询 | SmilChr07G004704 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995271 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776485.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057776485.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057776485.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057776485.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776485.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:59921179 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A15,A24,B112,B137,B18,B30,B53,B78,C18,C31,C42,C48 |
Chr7:59921236 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr7:59921266 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:59921277 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 22 | A15,A16,A21,B117,B135,B19,B21,B4,B50,B57,B69,B74,B75,B78,B79,B81,B84,C47,C51,C78,C85,D10 |
Chr7:59921289 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr7:59921304 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr7:59921304 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:59921356 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B90 |
Chr7:59921373 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B33 |
Chr7:59921382 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,B35 |
Chr7:59921440 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,D9 |
Chr7:59921444 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。