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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004706`

染色体: Chr07 坐标: 59934084-59936166 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004706`
名称	SmilChr07G004706
描述	uncharacterized SmilChr07G004706
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59934084 - 59936166 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995273`
GeneID	`130995273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995273`
原始查询	`SmilChr07G004706`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776487.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776487.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776487.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776488.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59934445`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	86	A19,A2,A24,A4,A5,A7,A8,A9,B100,B101,B104,B105,B111,B114,B115,B120,B123,B125,B128,B13,B133,B137,B138,B14,B15,B17,B2,B21,B23,B27,B28,B34,B36,B37,B39,B40,B42,B43,B46,B5,B50,B57,B63,B65,B69,B70,B79,B81,B82,B83,B91,B93,B94,B99,C1,C18,C19,C2,C24,C30,C31,C35,C38,C39,C40,C44,C48,C51,C54,C57,C59,C60,C67,C69,C72,C75,C77,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C9,D3,D9
`Chr7:59934447`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	84	A19,A2,A24,A4,A5,A7,A8,A9,B100,B101,B104,B105,B111,B114,B115,B120,B123,B125,B128,B13,B133,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B2,B21,B27,B28,B34,B36,B37,B39,B40,B42,B43,B46,B5,B50,B57,B63,B65,B69,B70,B79,B81,B82,B83,B93,B94,B99,C1,C18,C19,C2,C24,C30,C31,C35,C38,C39,C40,C44,C48,C51,C54,C57,C59,C60,C67,C69,C72,C75,C77,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C9,D3
`Chr7:59934475`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B114
`Chr7:59934475`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B114
`Chr7:59934518`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A1,A14,A15,B1,B105,B108,B112,B113,B121,B13,B138,B20,B23,B29,B33,B34,B4,B40,B48,B55,B58,B62,B64,B70,B78,B81,B88,B89,B90,B95,B97,C13,C14,C25,C42,C46,C51,C60,C64,C65,C66,C67,C84,D5,D9
`Chr7:59934526`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B121,B29,B34,B64,B97
`Chr7:59934526`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B121,B29,B34,B64,B97
`Chr7:59934619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C83
`Chr7:59934692`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B108,B55,C62,D5
`Chr7:59934692`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B108,B55,C62,D5
`Chr7:59934731`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A23,B103,B108,B117,B133,B140,B4,B40,B48,B5,B55,B68,B81,B91,C10,C14,C45,C51,C57,C62,C7,C84,C86,D5,D6,D9
`Chr7:59934734`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A23,B103,B108,B117,B133,B140,B4,B40,B48,B5,B55,B68,B81,B91,C10,C14,C45,C51,C57,C62,C7,C84,C86,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776487.1

422 aa

211

422

F-box-like

F-box

FBA_3

PF12937 F-box-like 72-108 aa PF00646 F-box 72-112 aa PF08268 FBA_3 160-272 aa

XP_057776488.1

184 aa

184

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 72-108 aa PF00646 F-box 72-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776487.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	72	108	7.3e-08	32.8	F-box-like
`XP_057776487.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	72	112	5e-07	30.1	F-box domain
`XP_057776487.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	160	272	1.3e-07	31.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057776488.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	72	108	1.2e-08	35.2	F-box-like
`XP_057776488.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	72	112	2.3e-07	31.1	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920505.1
GTGTTGTATTCTCCCACACACTGTGTCTGTGCCCATTTCCTAGAATGTCACCTGAAATGAAAGTAAAGGGCATTGCGCTTAAAATTCGTTTATTTCCAGAATCGGCCCGCCGCGAGCCGCCACCGCCTCCCCGCCGCTGCAGCGATGGAAGCTTGCTTAGTGAAGACGAACAAGGAAATTCAAATAGATCGGTGGTCGAGGACTCTAGAAGTCGGTCTTATTATTTCAGGAGGTGTAAAAGGGTGAGGCCAACGAACATA...

XM_057920504.1
GTGTTGTATTCTCCCACACACTGTGTCTGTGCCCATTTCCTAGAATGTCACCTGAAATGAAAGTAAAGGGCATTGCGCTTAAAATTCGTTTATTTCCAGAATCGGCCCGCCGCGAGCCGCCACCGCCTCCCCGCCGCTGCAGCGATGGAAGCTTGCTTAGTGAAGACGAACAAGGAAATTCAAATAGATCGGTGGTCGAGGACTCTAGAAGTCGGTCTTATTATTTCAGGAGGTGTAAAAGGGTGAGGCCAACGAACATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995273
ATGTCACCTGAAATGAAAGTAAAGGGCATTGCGCTTAAAATTCGTTTATTTCCAGAATCGGCCCGCCGCGAGCCGCCACCGCCTCCCCGCCGCTGCAGCGATGGAAGCTTGCTTAGTGAAGACGAACAAGGAAATTCAAATAGATCGGTGGTCGAGGACTCTAGAAGTCGGTCTTATTATTTCAGGAGGTGTAAAAGGGTGAGGCCAACGAACATAGAGTCCCTCCCCAGCGAGCTCTTATCCGACATCCTCGTGCGTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776487.1
MSPEMKVKGIALKIRLFPESARREPPPPPRRCSDGSLLSEDEQGNSNRSVVEDSRSRSYYFRRCKRVRPTNIESLPSELLSDILVRLPADHLYDRVRLVCRRWYHIIHSYDFVNTQIQHSTYGLLLCCIGVWGGHHPILITATQGGRIETSEFTYLDRGRFLNSCNGLCLEVHSIHRYPYIINPATKQAFMIPTIPNAVTHARRFGMAFAPRSMKYKLTTLYRRFKQRHLAILTFGVDKSWRDVALDSFRERNQVFNILS...

XP_057776488.1
MSPEMKVKGIALKIRLFPESARREPPPPPRRCSDGSLLSEDEQGNSNRSVVEDSRSRSYYFRRCKRVRPTNIESLPSELLSDILVRLPADHLYDRVRLVCRRWYHIIHSYDFVNTQIQHSTYGLLLCCIGVWGGHHPILITATQGGRIETSEFTYLDRGRFLNSCNGLCLEAIWYGICSTFHEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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