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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004709`

染色体: Chr07 坐标: 59952535-59954965 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004709`
名称	SmilChr07G004709
描述	adenine phosphoribosyltransferase 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59952535 - 59954965 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995276`
GeneID	`130995276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995276`
原始查询	`SmilChr07G004709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenine phosphoribosyltransferase 5-like
产物	adenine phosphoribosyltransferase 5-like
Arabidopsis	`AT5G11160` (APT5) adenine phosphoribosyltransferase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830985] identity=75.5; qcov=1; evalue=5.06e-103; confidence=high
Rice	`Os07g0484800` (OJ1753_E03.106) - identity=74.1; qcov=0.906; evalue=4.59e-89; confidence=high
GO	GO:0003999 (adenine phosphoribosyltransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0006168 (adenine salvage)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00156 (Pribosyltran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776491.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776491.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776491.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776491.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776491.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59952794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C4,C55
`Chr7:59953288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A5,B112,C58
`Chr7:59954249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C58,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776491.1

192 aa

192

Pribosyltran

PF00156 Pribosyltran 52-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776491.1`	Pfam	`PF00156`	Pribosyltran	Domain	52	169	7.5e-16	58.6	Phosphoribosyl transferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920508.1
AGATAATTTGCCAAATCCCAAATATCTAAAGTGGACTTTGGTATGATTTTGAAAATTTCCCGCATCACACTTCATTTCTATAAAACCACAGCACCAAATTCTTTTTAGCAAGCTCAAGCTGTGTGTGTGAGACAGAGGAGAGAGAGAGAGAAACACACACATTTCACACACTAGGGGAGAGGAAGATGTTTGCGGCAGAGAATGGGTTGAAGGGAGACCCCAGACTTGAGGCAATTTCTGAGGCAATTAGAGTGATACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995276
ATGTTTGCGGCAGAGAATGGGTTGAAGGGAGACCCCAGACTTGAGGCAATTTCTGAGGCAATTAGAGTGATACCCCATTTCCCAAAACCAGGTATAATGTTCCAAGATATAACCCCTTTGTTTCTCAACCACAAAGTTTTCAAAGACACAGTGGACATTTTTGTCGAGAGATACAAAGACATGGGCATTTCTGTTGTTGCAGGAATTGAAGCAAGAGGGTTTATGTTTGCTCCTTGTGTTGCCTTGGCTATTGGTGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776491.1
MFAAENGLKGDPRLEAISEAIRVIPHFPKPGIMFQDITPLFLNHKVFKDTVDIFVERYKDMGISVVAGIEARGFMFAPCVALAIGAKFVPLRKRGKLPGKVISEAYELEYGKDCLEMHVGAVQQGEKAVVIDDLVATGGTLSAAIKLLECMGAEVVECACVIGVPELIKDQNRLNGKALYMLVEPSEVEGCC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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