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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004721`

染色体: Chr07 坐标: 60098627-60099659 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004721`
名称	SmilChr07G004721
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase HPGT3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60098627 - 60099659 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995286`
GeneID	`130995286`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995286`
原始查询	`SmilChr07G004721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase HPGT3-like
产物	hydroxyproline O-galactosyltransferase HPGT3-like
Arabidopsis	`AT2G25300` (AT2G25300) Galactosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817068] identity=69.9; qcov=0.988; evalue=6.99e-43; confidence=medium
Rice	`Os06g0177300` - identity=72.8; qcov=0.964; evalue=1.66e-43; confidence=medium
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01762 (Galactosyl_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057776506.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057776506.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776506.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776506.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60098974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr7:60098975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr7:60099007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B33
`Chr7:60099143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C39
`Chr7:60099158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C18,D2
`Chr7:60099198`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr7:60099198`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2
`Chr7:60099203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B20,B87,C24,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776506.1

87 aa

Galactosyl_T

PF01762 Galactosyl_T 14-66 aa

XP_057776507.1

84 aa

Galactosyl_T

PF01762 Galactosyl_T 14-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776506.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	14	66	4.4e-09	37.1	Galactosyltransferase
`XP_057776507.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	14	66	4.1e-09	37.2	Galactosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920523.1
CTAGGCTTATCCTCAAAAGGAAATGTCACCTCAGTGTATGGACCAATCTGTATGTGTCTTATTTACTGTATTATTATAATTATGTTTTATCAATAAATTTTAGTTTCTTATTTAGAAGAAAGAACATGAAATGCAAATCACCTTTCTAAACTGGAAAACATTGTTCAATTTTCAGGGGAATGCAATGGTATGAGCCTGAATGGTGGAAATTTGGTGATCAGAAATCGTATTTCCGTCATGCAGCCGGTTCTATCTTCATA...

XM_057920524.1
CCTCAAAAGGAAATGTCACCTCAGTGTATGGACCAATCTGTATGTGTCTTATTTACTGTATTATTATAATTATGTTTTATCAATAAATTTTAGTTTCTTATTTAGAAGAAAGAACATGAAATGCAAATCACCTTTCTAAACTGGAAAACATTGTTCAATTTTCAGGGGAATGCAATGGTATGAGCCTGAATGGTGGAAATTTGGTGATCAGAAATCGTATTTCCGTCATGCAGCCGGTTCTATCTTCATACTCTCAAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995286
ATGCAATGGTATGAGCCTGAATGGTGGAAATTTGGTGATCAGAAATCGTATTTCCGTCATGCAGCCGGTTCTATCTTCATACTCTCAAAAAATTTAGCTAAGTACATACATATCAATAGTGCATCCTTGAAGGTTTATGCTCACGAGGATGTATCCGTGGGGTCATGGATGATGGGTCTTCGCGCAACCTATATAGATGACAGCCGTATGTGCTGTAGTTACTCAAGCCAAGAGAAACAGAGGAACTCATGGATCTTTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776506.1
MQWYEPEWWKFGDQKSYFRHAAGSIFILSKNLAKYIHINSASLKVYAHEDVSVGSWMMGLRATYIDDSRMCCSYSSQEKQRNSWIFS

XP_057776507.1
MQWYEPEWWKFGDQKSYFRHAAGSIFILSKNLAKYIHINSASLKVYAHEDVSVGSWMMGLRATYIDDSRMCCSYSSQDKICSLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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