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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004723`

染色体: Chr07 坐标: 60110203-60121051 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004723`
名称	SmilChr07G004723
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60110203 - 60121051 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995289`
GeneID	`130995289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995289`
原始查询	`SmilChr07G004723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=33.7; qcov=0.537; evalue=6.13e-61; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=34.7; qcov=0.583; evalue=1.13e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057776508.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776508.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776508.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776508.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60110270`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A16,A3,B107,B128,B54,B58,B74,B78,B83,B84,B9,B90,B91,C3,C33,C39,C5,C52,C83,C84
`Chr7:60110283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B102,B130,C45,C54
`Chr7:60110332`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B124,B30,B45,B92,C30,C64,C80,D11
`Chr7:60110336`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	A2,A25,A5,B107,B110,B119,B123,B134,B136,B14,B24,B29,B31,B42,B50,B52,B54,B56,B59,B7,B77,B9,B96,B97,C10,C15,C27,C5,C52,C56,C74,C75,C86,D10
`Chr7:60110338`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A25,A5,A9,B10,B107,B109,B110,B119,B123,B129,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B16,B17,B22,B24,B29,B31,B32,B42,B50,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B7,B77,B9,B96,B97,C10,C15,C17,C21,C26,C27,C41,C46,C47,C5,C52,C56,C68,C7,C72,C73,C74,C75,C86,D10
`Chr7:60110341`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A3,B109,B113,B132,B19,B48,B52,B77,B81,B86,C43,C44,C65,C81
`Chr7:60110348`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B124,B30,B45,B92,C30,C64,C80,C84,D11
`Chr7:60110384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:60110415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B27,B73,C69
`Chr7:60110425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B58,B87,C30
`Chr7:60110431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr7:60110440`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	95	A1,A10,A21,A22,A3,A4,A9,B1,B100,B101,B102,B105,B109,B110,B112,B113,B115,B117,B121,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B15,B16,B18,B19,B20,B22,B23,B25,B27,B28,B36,B38,B41,B45,B48,B51,B55,B58,B6,B61,B63,B66,B71,B72,B73,B75,B77,B79,B8,B82,B86,B87,B89,B95,B97,C1,C13,C18,C21,C22,C32,C36,C39,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C50,C57,C59,C62,C63,C67,C68,C69,C72,C73,C76,C78,C79,C81,C83,C85,D2,D3,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776508.1

901 aa

450

901

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 196-357 aa PF23559 WHD_DRP 453-513 aa PF23598 LRR_14 566-863 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776508.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	196	357	9.6e-43	146.5	NB-ARC domain
`XP_057776508.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	453	513	2.6e-17	63.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057776508.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	566	863	1.1e-17	64.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920525.1
TAATATTGCTACCAACCAAACACTCTTTCGTCTCCAACAACACTTCCGTTGACCAATTTTCATTTTGCAATCTGCAATTTAATCTGAGATGGCAGCTTATGCAGCTCTCGCTTCTCTCTTGAATACGATTGAGCAGATGATGACCCATCCTCCTATTTCCACTTCTTTCGACAACAATCAGATCCAATCTCTTAAGGAGAAGGCTGATTTGTTGCTCGATTTCATAGAGACCTTTAATTATGGTGGAGTTAGCGAAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995289
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTCGCTTCTCTCTTGAATACGATTGAGCAGATGATGACCCATCCTCCTATTTCCACTTCTTTCGACAACAATCAGATCCAATCTCTTAAGGAGAAGGCTGATTTGTTGCTCGATTTCATAGAGACCTTTAATTATGGTGGAGTTAGCGAAGAAGCACAAGATCTCGAAAGCCTAATCACATCTGCTGCTCATACAGCCCAAGATATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAACTCCTTCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776508.1
MAAYAALASLLNTIEQMMTHPPISTSFDNNQIQSLKEKADLLLDFIETFNYGGVSEEAQDLESLITSAAHTAQDMIESHIVNQLLPLSADDREAALSFSLYLQKKRAIEEKNAAAVGDVDQVHGGSNQAFDHVAGDGCLEYLRQIIEDMDAIIGKANELMEKQRVREDQPPTHSTPQYTQTGEETAMVGFRDELIQLLDELTGQRSNLHTISIVGMGGMGKTTLAKTIYANQLIIERFDIRAWATVSQLYNAKQILQQLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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