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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004730`

染色体: Chr07 坐标: 60184967-60188167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004730`
名称	SmilChr07G004730
描述	protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R7 homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60184967 - 60188167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995292`
GeneID	`130995292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995292`
原始查询	`SmilChr07G004730`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R7 homolog
产物	protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R7 homolog
Arabidopsis	`AT5G19680` (AT5G19680) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832088] identity=69.5; qcov=0.982; evalue=1.81e-165; confidence=high
Rice	`Os02g0230100` - identity=70.6; qcov=0.946; evalue=8.89e-162; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12799 (LRR_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776510.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776510.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776510.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776510.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60185151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,C1,C5,C7,C77
`Chr7:60185153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B35,C45,C46,C49
`Chr7:60185171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:60185219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C6
`Chr7:60185252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C56
`Chr7:60185264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B73,C82,C85
`Chr7:60185282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:60187220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr7:60187221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr7:60187369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:60187403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B94
`Chr7:60187410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776510.1

352 aa

176

352

LRR_4

PF12799 LRR_4 224-264 aa PF12799 LRR_4 245-285 aa

XP_057776511.1

331 aa

166

331

LRR_4

PF12799 LRR_4 224-264 aa PF12799 LRR_4 245-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776510.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	224	264	1.7e-37	127.3	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057776510.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	245	285	1.7e-37	127.3	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057776511.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	224	264	4.4e-38	129.1	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057776511.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	245	285	4.4e-38	129.1	Leucine Rich repeats (2 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920528.1
AATTTTTAAAATTTATTTTAATATATCCTTAAATAAATAAAAAATACTAAAAGATAAATTAAAGAATAATAAAGAAGGGAAGCAAGACGCAGATTTCCGCCAAGATCAATCGTCGTCTCCCGAAAAAATGGACTCGTCGGCGCAACCAGAAAACCACGATCCGCCGTCTGAGAGCGACGGCGCACCGACGCTCCTGGATCTGAGCAGCTGCCAGCTGCGCGATCTCAGCTCCGTCGACCTGCCGTCCACTATCGTCGAAG...

XM_057920527.1
ATAAATTAAAGAATAATAAAGAAGGGAAGCAAGACGCAGATTTCCGCCAAGATCAATCGTCGTCTCCCGAAAAAATGGACTCGTCGGCGCAACCAGAAAACCACGATCCGCCGTCTGAGAGCGACGGCGCACCGACGCTCCTGGATCTGAGCAGCTGCCAGCTGCGCGATCTCAGCTCCGTCGACCTGCCGTCCACTATCGTCGAAGTAGACCTCACGGCGAACCGGCTGACGGCGTTAGACCCCCGTCTCTCGCAGCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995292
ATGGACTCGTCGGCGCAACCAGAAAACCACGATCCGCCGTCTGAGAGCGACGGCGCACCGACGCTCCTGGATCTGAGCAGCTGCCAGCTGCGCGATCTCAGCTCCGTCGACCTGCCGTCCACTATCGTCGAAGTAGACCTCACGGCGAACCGGCTGACGGCGTTAGACCCCCGTCTCTCGCAGCTCTCCAATCTCAAGAAGCTCTCTCTGCGCCAAAACCTCCTTAACGACGACGCCGTCCTCCCCTTATCGTCCTGGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776510.1
MDSSAQPENHDPPSESDGAPTLLDLSSCQLRDLSSVDLPSTIVEVDLTANRLTALDPRLSQLSNLKKLSLRQNLLNDDAVLPLSSWHSISALQELVLRDNQMKKIPDVTIFKMLLVFDVSFNEITSLSGLSKVSNTLKELYVSKNEVTKIEEIEHFHELQILELGSNRLRVMENLQNLSSLLELWLGRNRIRVIDLCGLKCIKKISLQSNRLTSMAGLEDCVALEELYLSHNGIAKMEGLSTLVNLRVLDVASNKLTEIN...

XP_057776511.1
MDSSAQPENHDPPSESDGAPTLLDLSSCQLRDLSSVDLPSTIVEVDLTANRLTALDPRLSQLSNLKKLSLRQNLLNDDAVLPLSSWHSISALQELVLRDNQMKKIPDVTIFKMLLVFDVSFNEITSLSGLSKVSNTLKELYVSKNEVTKIEEIEHFHELQILELGSNRLRVMENLQNLSSLLELWLGRNRIRVIDLCGLKCIKKISLQSNRLTSMAGLEDCVALEELYLSHNGIAKMEGLSTLVNLRVLDVASNKLTEIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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