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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004733`

染色体: Chr07 坐标: 60195476-60196945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004733`
名称	SmilChr07G004733
描述	40S ribosomal protein S11
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60195476 - 60196945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995297`
GeneID	`130995297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995297`
原始查询	`SmilChr07G004733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S11
产物	40S ribosomal protein S11
Arabidopsis	`AT5G23740` (RPS11-BETA) ribosomal protein S11-beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832439] identity=89.9; qcov=1; evalue=6.04e-97; confidence=high
Rice	`Os04g0502300` - identity=91.2; qcov=1; evalue=3.86e-95; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00366 (Ribosomal_S17); PF16205 (Ribosomal_S17_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776518.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776518.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776518.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776518.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60195736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B45
`Chr7:60195852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr7:60196122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B73
`Chr7:60196530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:60196676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5
`Chr7:60196679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776518.1

159 aa

159

Ribosomal_S17_N

Ribosomal_S17

PF16205 Ribosomal_S17_N 4-72 aa PF00366 Ribosomal_S17 74-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776518.1`	Pfam	`PF16205`	Ribosomal_S17_N	Family	4	72	3.7e-31	108.1	Ribosomal_S17 N-terminal
`XP_057776518.1`	Pfam	`PF00366`	Ribosomal_S17	Domain	74	142	2.4e-27	95.6	Ribosomal protein S17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920535.1
CAAAAGTTGGGGCTGGTGGAGTTGAAGAGGGGCAAAATAGAGTTTCAACTATGAACTGCATATATAAAAAGACAACATTTGACGTCTGAGCTCTCTCGTCGCTAGGGTTTTATCCGCCGCCGTCGCTGCCGCTTCCCGCATTTTCAGCTGAACACCGGAGAGAGCTACAATGGCTGAGCAGACTGAAAAGGCGTTCCTGAAGCAGCCCAAGGTGTTCCTATGCTCGAAGAAGACGGGGAAGGGTAAGCGGCCAGGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995297
ATGGCTGAGCAGACTGAAAAGGCGTTCCTGAAGCAGCCCAAGGTGTTCCTATGCTCGAAGAAGACGGGGAAGGGTAAGCGGCCAGGGAAAGGGGGCAACCGTTTTTGGAAGAGCATCGGATTGGGTTTCAAGACGCCTCGCGAGGCTACTGAAGGCACATACATTGACAAGAAATGCCCTTTCACTGGTGATGTCTCCATTAGAGGCCGTATTCTGGCCGGAACTTGTCACAGTGCTAAGATGATGAGAACTATCATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776518.1
MAEQTEKAFLKQPKVFLCSKKTGKGKRPGKGGNRFWKSIGLGFKTPREATEGTYIDKKCPFTGDVSIRGRILAGTCHSAKMMRTIIVRRNYLHWVKKYQRYEKRHSNIPAHISPCFRVKEGDHVIIGQCRPLSKTVRFNVLKVIPAGSSGLGKKAFTGM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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