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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004737`

染色体: Chr07 坐标: 60237223-60238628 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004737`
名称	SmilChr07G004737
描述	uncharacterized SmilChr07G004737
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60237223 - 60238628 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994553`
GeneID	`130994553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994553`
原始查询	`SmilChr07G004737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein, putative (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835460]; symbol=AT5G53790; hit=AT5G53790; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box protein, putative (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835460]; symbol=AT5G53790; hit=AT5G53790; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G53790` (AT5G53790) F-box protein, putative (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835460] identity=28.1; qcov=0.92; evalue=1.46e-13; confidence=low
Rice	`Os01g0328300` (OsFbox009) - identity=22.9; qcov=0.917; evalue=4.7e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775578.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775578.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775578.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775578.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775578.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60237760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B127
`Chr7:60237772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A15,A19,A4,B102,B109,B11,B117,B126,B127,B130,B135,B19,B2,B20,B22,B27,B37,B4,B49,B50,B51,B6,B66,B71,B72,B75,B8,B81,B97,C14,C36,C37,C41,C46,C47,C55,C62,C63,C67,C76,C84,D2
`Chr7:60237775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B40,B8,C16,C19
`Chr7:60237787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:60237789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B38,C35
`Chr7:60237815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B35,C45
`Chr7:60237851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C65
`Chr7:60237862`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C44
`Chr7:60237862`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C44
`Chr7:60237889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C5
`Chr7:60237918`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A8,B38,C35
`Chr7:60237918`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A8,B38,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775578.1

348 aa

174

348

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 26-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775578.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	26	302	6.8e-36	124.7	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919595.1
CGGAGGAGGGCCGTGGTTGATGCTTCCACCGGCGCGGTCGGGGAAGATGGCGGCGTACAAGTTATACTCCCCCGTGAAGGGACAAGTAGTGAGCTTTTTCAACATCAACGACAACGATAAGACGGTAGAGGTAATGCAGGACCCCGCAACTAAGTTGGTGGGGTCGTCGCACGGCTGGCTAGCTCTGTACAACCCCCGCCGCAGGGCCTTTTTCCTTTCGAATCCCCTCTCCGGCCGCCGCATAGATCTTCCGCAGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994553
ATGCTTCCACCGGCGCGGTCGGGGAAGATGGCGGCGTACAAGTTATACTCCCCCGTGAAGGGACAAGTAGTGAGCTTTTTCAACATCAACGACAACGATAAGACGGTAGAGGTAATGCAGGACCCCGCAACTAAGTTGGTGGGGTCGTCGCACGGCTGGCTAGCTCTGTACAACCCCCGCCGCAGGGCCTTTTTCCTTTCGAATCCCCTCTCCGGCCGCCGCATAGATCTTCCGCAGCCGCCCGACTTTTTGGAACCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775578.1
MLPPARSGKMAAYKLYSPVKGQVVSFFNINDNDKTVEVMQDPATKLVGSSHGWLALYNPRRRAFFLSNPLSGRRIDLPQPPDFLEPIHKVIVSSSPDEDDDCRALMMFSMQTCFYVCRPGRNAWTLLGKFGYEDFVYSAARKRFLCLLSEQVMIDFDDEEEFEPWDLECWSVVQEPEPTIDLEWMTKSLDSELFHKQVREVGACYEPVVHYTRYLVADDRRGRIYVVVRYIAWFEYEKTVGFDVYRIDKGFMKMKGSLDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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