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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004738`

染色体: Chr07 坐标: 60240955-60243267 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004738`
名称	SmilChr07G004738
描述	hydroxyproline O-arabinosyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60240955 - 60243267 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994555`
GeneID	`130994555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994555`
原始查询	`SmilChr07G004738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline O-arabinosyltransferase 1-like
产物	hydroxyproline O-arabinosyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G25265` (AT5G25265) Hyp O-arabinosyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832598] identity=72.6; qcov=0.894; evalue=1.26e-171; confidence=high
Rice	`Os06g0180000` - identity=69.9; qcov=0.92; evalue=2.37e-156; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00514 (Other types of O-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF23452 (HPAT); PF28609 (HPAT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057775580.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057775580.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775580.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775580.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60241120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr7:60241280`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B2
`Chr7:60241280`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B2
`Chr7:60241281`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B2
`Chr7:60241281`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B2
`Chr7:60242456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,C36,C39,C6
`Chr7:60242533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:60242703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B35,C45,C6
`Chr7:60242706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr7:60242708`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A4,B103,B110,B115,B133,B134,B135,B136,B140,B23,B31,B42,B43,B45,B64,B76,C10,C11,C15,C26,C27,C30,C45,C5,C52,C54,C56,C69,C74,C77,C8,C82
`Chr7:60243033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B140,B21
`Chr7:60243161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775580.1

339 aa

170

339

HPAT

HPAT_C

PF23452 HPAT 42-244 aa PF28609 HPAT_C 266-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775580.1`	Pfam	`PF23452`	HPAT	Domain	42	244	2.2e-84	283.5	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family N-terminal domain
`XP_057775580.1`	Pfam	`PF28609`	HPAT_C	Domain	266	334	4.9e-30	103.9	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919597.1
ATGAGAAAATAATTGATGCATGGATATAAAATAATAGAGTTTGGAGGTTGGTAGGCGGAGGATGGGGCGCAGGAAATTGTTCTTAACATTGGTGTTGGCGTGCCCAGCTCTACTCATCACTACTGCGATTCTCCTATCAGAAAAAGATGAACTGCCATCCATGAAGAAGAAGAATTCTAGAATGTTCCACACCGCGGTGACGTCGTCGGACTCCGTGTACAACACGTGGCAGTGCAGGGTGATGTACTACTGGTTCCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994555
ATGGGGCGCAGGAAATTGTTCTTAACATTGGTGTTGGCGTGCCCAGCTCTACTCATCACTACTGCGATTCTCCTATCAGAAAAAGATGAACTGCCATCCATGAAGAAGAAGAATTCTAGAATGTTCCACACCGCGGTGACGTCGTCGGACTCCGTGTACAACACGTGGCAGTGCAGGGTGATGTACTACTGGTTCCAGAAACACAACCCAAACAGCAACGAGATGGGCGGGTTCACGCGGATCCTGCATTCGGGTCGACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775580.1
MGRRKLFLTLVLACPALLITTAILLSEKDELPSMKKKNSRMFHTAVTSSDSVYNTWQCRVMYYWFQKHNPNSNEMGGFTRILHSGRPDSLMQEIPTFVAQPLPASLHRGYLVLNRPWALLQWLNQAQIREDYILMCEPDHLILSPIPNLTQDRRHGAAFPFFYIDPTAHEPVLRKFFPRHMGPITNIDSIGNSPLILGKEALKRIVPTWMNVSIAMKKDSEADKAFGWVLEMYAYAVASAMHDVPNVLHKEFMIQPPWDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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