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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004743`

染色体: Chr07 坐标: 60271552-60278690 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004743`
名称	SmilChr07G004743
描述	trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60271552 - 60278690 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992752`
GeneID	`130992752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992752`
原始查询	`SmilChr07G004743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 homolog
产物	trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 homolog
Arabidopsis	`AT5G11040` (TRS120) TRS120 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830971] identity=72.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0502200` (TRS120) - identity=64.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network)
KEGG	-
Pfam	PF08626 (TRAPPC9-Trs120); PF26251 (TPR_TRAPPC9-Trs120); PF26254 (Ig_TRAPPC9-Trs120_1st); PF26280 (Ig_TRAPPC9-Trs120_2nd); PF26282 (Ig_TRAPPC9-Trs120_3rd); PF26283 (Ig_TRAPPC9-Trs120_4th)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773481.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057773481.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057773481.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057773481.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60271765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:60271831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C83
`Chr7:60271871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A13,A19,A20,A21,B106,B121,B131,B16,B34,B61,B71,B74,B76,B86,C1,C11,C40,C51,C65,C69
`Chr7:60271895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr7:60271970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:60271977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:60272008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,D10
`Chr7:60272017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:60272024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B73,C83
`Chr7:60272024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C83
`Chr7:60272032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B87,C23,C32,C51,C79
`Chr7:60272052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773481.1

1198 aa

599

1198

TRAPPC9-Trs120

TPR_TRAPPC9-Trs120

Ig_TRAPPC9-Trs120_1st

Ig_TRAPPC9-Trs120_2nd

Ig_TRAPPC9-Trs120_3rd

Ig_TRAPPC9-Trs120_4th

PF08626 TRAPPC9-Trs120 10-181 aa PF08626 TRAPPC9-Trs120 203-268 aa PF26251 TPR_TRAPPC9-Trs120 331-493 aa PF26254 Ig_TRAPPC9-Trs120_1st 541-648 aa PF26280 Ig_TRAPPC9-Trs120_2nd 695-751 aa PF26282 Ig_TRAPPC9-Trs120_3rd 875-1037 aa PF26283 Ig_TRAPPC9-Trs120_4th 1074-1195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF08626`	TRAPPC9-Trs120	Domain	10	181	4e-32	112.4	Trs120/TRAPPC9, N-terminal domain
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF08626`	TRAPPC9-Trs120	Domain	203	268	4e-32	112.4	Trs120/TRAPPC9, N-terminal domain
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF26251`	TPR_TRAPPC9-Trs120	Repeat	331	493	4.7e-12	46.6	Trs120/TRAPPC9 TPR
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF26254`	Ig_TRAPPC9-Trs120_1st	Domain	541	648	4.7e-23	82.7	Trs120/TRAPPC9, first Ig-like domain
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF26280`	Ig_TRAPPC9-Trs120_2nd	Domain	695	751	4.9e-09	37.1	Trs120/TRAPPC9, second Ig-like domain
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF26282`	Ig_TRAPPC9-Trs120_3rd	Domain	875	1037	1.2e-11	45.5	Trs120/TRAPPC9, third Ig-like domain
`XP_057773481.1`	Pfam	`PF26283`	Ig_TRAPPC9-Trs120_4th	Domain	1074	1195	2.8e-12	47.3	Trs120/TRAPPC9, fourth Ig-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917498.1
GGTTGGGCCTATTAGAGAAGCCCATATTGAAGCTGAACCTCTGCTGTTGATGGGATGCGGTTATTTGCTATGTTGGCTTTACTACCGTAGCAGATCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTCTGCTAATCGGAAAACATGGAGCCCGACGCCAGCATCGAAACGAACAGCATGATCCGGGTGGCGGTGATCCCCATCTCCGACGTTACCCCGCTTCTCTTCCGCGACTACGCCGCGATGCTCCTCCGCCACCACACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992752
ATGGAGCCCGACGCCAGCATCGAAACGAACAGCATGATCCGGGTGGCGGTGATCCCCATCTCCGACGTTACCCCGCTTCTCTTCCGCGACTACGCCGCGATGCTCCTCCGCCACCACACCGTCTCCCTCAACTCCATCAGCTCCTTCTACACCGAGCACCAGAAATCCCCCTTTGCTCACCAACCCTGGGAATCTGGAAGCCTCCGTTTCAAGTTCATTCTCGGCGGATCGCCGCCTTCTCCCTGGGAGGATTTCCAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773481.1
MEPDASIETNSMIRVAVIPISDVTPLLFRDYAAMLLRHHTVSLNSISSFYTEHQKSPFAHQPWESGSLRFKFILGGSPPSPWEDFQSNRKILAVIGICHCPSAPDLRSVADQFTAACKSYSSSLVQRCFAFCPGDSQLEDESVKGSNLILFPPADRQTQEFHLQTMVQDIAASLLMEFEKWVLQGESGGTIFKTPLDSQASLSSEEVIKAKKRRLGRAQKTIGDYCLLAGSPVDANAHYSTALELTRLTADFFWYAGAME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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