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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000009`

染色体: Chr08 坐标: 97486-100787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000009`
名称	SmilChr08G000009
描述	chloride channel protein CLC-e
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	97486 - 100787 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999629`
GeneID	`130999629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999629`
原始查询	`SmilChr08G000009`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloride channel protein CLC-e
产物	chloride channel protein CLC-e
Arabidopsis	`AT4G35440` (CLC-E) chloride channel E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829696] identity=58.1; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0720700` (OsCBSCLC9) - identity=41.1; qcov=0.864; evalue=1.68e-132; confidence=medium
GO	GO:0005247 (voltage-gated chloride channel activity); GO:0006821 (chloride transport); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS); PF00654 (Voltage_CLC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781205.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057781205.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057781205.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057781205.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781205.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:97896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C28
`Chr8:97937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B121,B48,B94,D7
`Chr8:98535`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,B1,B10,B102,B106,B112,B119,B15,B19,B26,B30,B32,B49,B60,B75,B84,B88,B90,B92,C13,C14,C22,C32,C52,C54
`Chr8:98552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:98827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B14,B73,C72
`Chr8:99048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B132,B36,D11,D2
`Chr8:99061`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B102,B54,B90
`Chr8:99061`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B102,B54,B90
`Chr8:99066`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A23,B120,B23,B24,B42,B43,B63,B73,C18,C33,C35,C45,C48,D4,D5
`Chr8:99104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B40,C60,C62
`Chr8:99208`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A13,A15,A21,A24,A6,B108,B109,B115,B126,B138,B14,B16,B3,B37,B50,B56,B57,B58,B78,B96,C46,C57,C6,C68,C77,C8,D11
`Chr8:99446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C44,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781205.1

723 aa

362

723

Voltage_CLC

CBS

PF00654 Voltage_CLC 194-521 aa PF00571 CBS 570-623 aa PF00571 CBS 657-698 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781205.1`	Pfam	`PF00654`	Voltage_CLC	Family	194	521	6.5e-70	236.7	Voltage gated chloride channel
`XP_057781205.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	570	623	5.5e-15	56.1	CBS domain
`XP_057781205.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	657	698	5.5e-15	56.1	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925222.1
TAATACCAAAGTTGCCAAAAATTCATCTTCATGTACGTTTGATATATGGTAGCCACAAATTATTGACCAAAAATAAAGGAGAAATGGATTTGTGTGGTGTGAGCAAGTTGCAAGATGAAGAATGGGCCACGTATGATATGACTTACTTTTCTTCATTATGGATAAGGTGAAAAAAGGTTTTGTTCTCGGCCGCTGCTATAAATACTTACACAACCTCCGCCGCCGCTGCCATCGCTCGCCGCCGGCAGGCTCTGATATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999629
ATGCAGTGCAGATTTACTGCATCAACCACAAAATATACTGCTACTGCAAACCACAACAACTTCCATCATCATGTATCATCTGCATCGACATTTCCATCTCTTCTTAGCAACTATAGGATTGCATTTTATCCCTCCGCCAAAACTACCTTTCACCATGTGAAGTCTTTTCCTTTACACCGCCGCAGATTTGTTGGGCCTGGCAAAGTTGATTCTAGTAATAATGGCCGCAATGCGGCGGACGAAGCTCAAGAAGAACAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781205.1
MQCRFTASTTKYTATANHNNFHHHVSSASTFPSLLSNYRIAFYPSAKTTFHHVKSFPLHRRRFVGPGKVDSSNNGRNAADEAQEEQDDDDELPELLQLGNSAILPACFVGLFTGIAIVLFNYTVHEIRDLSWGEIPGRGATWLREQPIDTKWGRVVLVPALGGLIVSLLNMIRTWLEDSADGNAMSNFKSALKPILKTAAACVTLGTGNSLGPEGPSVEIGVSVAKGVGAFLDRGAQRKLSLRAAGSAAGIAAGFNAAVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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