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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000014`

染色体: Chr08 坐标: 117309-122257 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000014`
名称	SmilChr08G000014
描述	actin-related protein 7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	117309 - 122257 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999639`
GeneID	`130999639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999639`
原始查询	`SmilChr08G000014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 7
产物	actin-related protein 7
Arabidopsis	`AT3G60830` (ARP7) actin-related protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825254] identity=77.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0783000` (ARP7) - identity=73.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009653 (anatomical structure morphogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781216.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781216.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781216.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057781216.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:117627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:120234`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr8:120234`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr8:120243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C24,C49
`Chr8:120286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	200	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B35,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B5,B51,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B63,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C70,C71,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:120401`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A4,B129,B64,C74,C82
`Chr8:120401`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A4,B129,B64,C74,C82
`Chr8:120699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:120726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:120732`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	210	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B5,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C41,C43,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C82,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:120776`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A4,B64,C19,C74,C82
`Chr8:120776`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A4,B64,C19,C74,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781216.1

361 aa

180

361

Actin

PF00022 Actin 2-186 aa PF00022 Actin 192-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781216.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	2	186	4e-71	240.5	Actin
`XP_057781216.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	192	361	4e-71	240.5	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925233.1
CATATAAATAAATGATATAATCCATTCATACTCATAGCATTAAATGGGGTAGATTTACATGACAACATTTTCGAATTCCCAATTTCCAACTTTGTCCTTCACTTTGCATTATAAAAAGGTCGGAAAGAAAATAAAAAAAGAATATAGAGACCTAAGTAGCCATCGGCGGTTCACCGTGTTGTGGAGCGCCGGCGTCGTTTCCAGCTCAGACATTGCATGCATTTGCACCCACCTACTCAAACCCTAAGAATTCGCCGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999639
ATGGACGCCGTGGTGGTTGACGCTGGAACTAAGCTGCTCAAATCCGGCTTTGCTGTTCCCGACCAGCCTCCTTCTATGGTAATTCCAACACAAATGAAACGTGTACCTGAAGATGAGTCCTTGGCGGATTCCTCTTCCCTTGAAAATGTGATTATTGATCCAGTTGTCCGAGGCTTTATTAGAGATTGGGATGCCATGGAAGATTTATTGAGCCATGTGTTATATACTGGTCTGGGTTGGGAGATTGGCAATGAGGGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781216.1
MDAVVVDAGTKLLKSGFAVPDQPPSMVIPTQMKRVPEDESLADSSSLENVIIDPVVRGFIRDWDAMEDLLSHVLYTGLGWEIGNEGQILFTDPLATPKAVREQLVQLMFEKFNISGFFASEQAVLSLYAVGRISGCTVDIGHGKMDIASVIEGAVQHISSRRFEIGGLDLTNLFAQELRKSNPHVNVTISDVEKLKEQYACCAEDDTAYRRFQQGCPEEQHTLPDGQVIKIGRERYTVGEALFQPAILGLEAHGIVEQLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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