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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000028`

染色体: Chr08 坐标: 185424-189535 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000028`
名称	SmilChr08G000028
描述	poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	185424 - 189535 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999653`
GeneID	`130999653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999653`
原始查询	`SmilChr08G000028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like
产物	poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like
Arabidopsis	`AT2G31870` (TEJ) Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817745] identity=56.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0843900` (OSJNBa0032G11.11) - identity=55.1; qcov=0.455; evalue=4.89e-65; confidence=medium
GO	GO:0004649 (poly(ADP-ribose) glycohydrolase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006282 (regulation of DNA repair); GO:0009225 (nucleotide-sugar metabolic process); GO:0031056 (GO:0031056); GO:1990966 (ATP generation from poly-ADP-D-ribose)
KEGG	smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05028 (PARG_cat_C); PF20811 (PARG_cat_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781233.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781233.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781233.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781233.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:186142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B44
`Chr8:186197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B38,B39
`Chr8:186199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C14,C8
`Chr8:186213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:186597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr8:186711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:186748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C14
`Chr8:187305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D4
`Chr8:187315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr8:187317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D4
`Chr8:187319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B98
`Chr8:188167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B113,B75,C52,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781233.1

543 aa

272

543

PARG_cat_N

PARG_cat_C

PF20811 PARG_cat_N 83-214 aa PF05028 PARG_cat_C 233-482 aa

XP_057781234.1

543 aa

272

543

PARG_cat_N

PARG_cat_C

PF20811 PARG_cat_N 83-214 aa PF05028 PARG_cat_C 233-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781233.1`	Pfam	`PF20811`	PARG_cat_N	Domain	83	214	5.2e-33	114.5	Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), helical domain
`XP_057781233.1`	Pfam	`PF05028`	PARG_cat_C	Domain	233	482	4.6e-84	281.9	Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), Macro domain fold
`XP_057781234.1`	Pfam	`PF20811`	PARG_cat_N	Domain	83	214	5.2e-33	114.5	Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), helical domain
`XP_057781234.1`	Pfam	`PF05028`	PARG_cat_C	Domain	233	482	4.6e-84	281.9	Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), Macro domain fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925250.1
ATTAACCAGTGCGATTCAAAATTTTAACTGATTGAAGATCGTCAGTTAGAGCTCGAAATTGAATCTGTGAACTGCGATCCATGTAGAATTGAATCGATTTCCGTTCAAATTTCCGCCATTTCCGCCGTAAAACTCTGGAAATTTGCCGTCGTCTGGCCACTGGCGGTGGCGGAAGCCTTCAAATCGCTCTACTGGAGACCGAGTCTCCATTGCTGACCTACACAATTAGTGTTGTATTTAATTCTCTCCATTCCTTTGCC...

XM_057925251.1
ATTCAAAATTTTAACTGATTGAAGATCGTCAGTTAGAGCTCGAAATTGAATCTGTGAACTGCGATCCATGTAGAATTGAATCGATTTCCGTTCAAATTTCCGCCATTTCCGCCGTAAAACTCTGGAAATTTGCCGTCGTCTGGCCACTGGCGGTGGCGGAAGCCTTCAAATCGCTCTACTGGAGACCGAGTCTCCATTGCTGACCTACACAATTAGTGTTGTATTTAATTCTCTCCATTCCTTTGCCTCTCTCGGATTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999653
ATGGAGAATCGTGAGGATTTCCTGTCAATTTTGCCGTATTTGCCTTTAATCCTCCGTTCCTCCGCTGTTTTCTGGCCGCCATCGGTGGTGGAAGCTCTCAAATCCCTATCCAAGGGACCGAGTCATAGCAATGTCAACTCCGGACAACTCTTTGCTCTCGCCGTGTCTGATCTCCGCAGCTCCCTTGGGGAGTATACTCTTTTCCCGTCAGCCTCTCTCGGCTTCTCACTCTTCTTCGATGATTTGATGAGTAAGGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781233.1
MENREDFLSILPYLPLILRSSAVFWPPSVVEALKSLSKGPSHSNVNSGQLFALAVSDLRSSLGEYTLFPSASLGFSLFFDDLMSKDEAGKWFTDVVPRLSDLLLRLPELLETHYQNAGSFCGMETGLRLLESQQPGIVLLSQELIAALLVCALFCLFPTTNRRAEHLPPINFDNLFACLYECYDVNQEHKIKCLVHYFETICLTIPLGNVSFERKVLPLKNSRSHIAYPEPDFWSKSTVSLCQFKVHNSGLIEDQSVEAL...

XP_057781234.1
MENREDFLSILPYLPLILRSSAVFWPPSVVEALKSLSKGPSHSNVNSGQLFALAVSDLRSSLGEYTLFPSASLGFSLFFDDLMSKDEAGKWFTDVVPRLSDLLLRLPELLETHYQNAGSFCGMETGLRLLESQQPGIVLLSQELIAALLVCALFCLFPTTNRRAEHLPPINFDNLFACLYECYDVNQEHKIKCLVHYFETICLTIPLGNVSFERKVLPLKNSRSHIAYPEPDFWSKSTVSLCQFKVHNSGLIEDQSVEAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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