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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000043`

染色体: Chr08 坐标: 285804-287400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000043`
名称	SmilChr08G000043
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	285804 - 287400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999670`
GeneID	`130999670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999670`
原始查询	`SmilChr08G000043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=32.4; qcov=1.04; evalue=3.08e-64; confidence=low
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=27; qcov=1.07; evalue=2.71e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781257.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781257.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781257.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781257.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:286129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B3,C2,C70
`Chr8:286150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:286157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C79
`Chr8:286174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:286176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:286186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B23,B35,B7,B98
`Chr8:286224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr8:286228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:286239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B95,C1
`Chr8:286245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B84,B95,C1
`Chr8:286299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:286306`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A15,A25,B100,B105,B120,B138,B19,B24,B29,B6,B89,C1,C21,C24,C30,C66,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781257.1

425 aa

212

425

Transferase

PF02458 Transferase 1-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781257.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	419	2.1e-67	228.4	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925274.1
CTACTCTTGTGTGTATCAAGTATCAACTCCATTAATTACTAGTGATTAAAAAAAATGAAGATGAACAAAATCAGCAGCAAGTTGATAAAGCCACACACACCAACCCCTCAAAACCTCAAGAATTACAAGTTATCGTTTATGGATGAGCTTACTCCTCCGATGCATATTGCTGTTATTCTGTTTTACGAATCGAAACCCGAAGACGCCAGCCTCCGGTTGGAAGAATCACTGGCCAGAATCTTGGTTGATTTCTATCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999670
ATGAAGATGAACAAAATCAGCAGCAAGTTGATAAAGCCACACACACCAACCCCTCAAAACCTCAAGAATTACAAGTTATCGTTTATGGATGAGCTTACTCCTCCGATGCATATTGCTGTTATTCTGTTTTACGAATCGAAACCCGAAGACGCCAGCCTCCGGTTGGAAGAATCACTGGCCAGAATCTTGGTTGATTTCTATCCTCTTGCAGGAAGATTCATCAAGAATGAAAGCTTGATTGATTGCAGCGATGAGGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781257.1
MKMNKISSKLIKPHTPTPQNLKNYKLSFMDELTPPMHIAVILFYESKPEDASLRLEESLARILVDFYPLAGRFIKNESLIDCSDEGAELVEAEALGVELIDLVAKIEIDQLHDLLPDQHFRVDEAVENPLLSIQVTRFPCGGAAVAVSVSHKVFDASSVGTFVAAWSDAAANPGHDTRVKPSFHLRSLLPSASRAPDFVQPSADHEFFLKRVLFDKEALTRLKSRISQTNGKPLSGVRVVCAVIAKALIRLHAAVNGRGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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