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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000049`

染色体: Chr08 坐标: 304289-305808 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000049`
名称	SmilChr08G000049
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	304289 - 305808 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999673`
GeneID	`130999673`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999673`
原始查询	`SmilChr08G000049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=29.4; qcov=1.05; evalue=4.03e-52; confidence=low
Rice	`Os04g0664600` (AHT1) - identity=24.8; qcov=1.07; evalue=6.25e-23; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781261.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781261.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781261.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781261.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:304433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:304469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:304505`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A19,A22,A25,A7,B103,B115,B118,B120,B124,B133,B138,B139,B17,B19,B20,B3,B32,B33,B37,B38,B39,B41,B48,B56,B58,B64,B70,B74,B75,B82,B89,B95,C1,C10,C22,C24,C27,C32,C35,C37,C44,C52,C55,C57,C59,C68,C69,C79,C84,D11,D8
`Chr8:304560`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A22,B45,B57,B81,C82,D10
`Chr8:304585`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B113,B131,B52,B72,C5,C71
`Chr8:304621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B7
`Chr8:304624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:304635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B115,C51
`Chr8:304666`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A23,B111,B121,B127,B14,B16,B21,B25,B31,B48,B54,B55,B61,B73,B78,C15,C18,C23,C32,C54,C62,C75,D10
`Chr8:304709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:304737`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B103,B135,B16,B48,B70,B78,C32,C45
`Chr8:304773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781261.1

434 aa

217

434

Transferase

PF02458 Transferase 1-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781261.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	428	6e-65	220.3	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925278.1
CGATATTTATCTATAAATTCATCGAGTACATATACATGAATGTAGGTATAGCTGAAAACCATCCCCTGCAAACATGAAGGTTGAAAAACTCAGCTGCAAATTGATAAAACCACACACACCAACTCCTCAAAATCTCAAAAACTACAAGTTATCTTTGATAGATAAGTATGAAGCGGCCATGAATTTTGCTGTGGTTCTGTTTTACGAATCGAGAGCAGCATATACCAGCAGCCATATATTGGAAGAATCACTGGCCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999673
ATGAAGGTTGAAAAACTCAGCTGCAAATTGATAAAACCACACACACCAACTCCTCAAAATCTCAAAAACTACAAGTTATCTTTGATAGATAAGTATGAAGCGGCCATGAATTTTGCTGTGGTTCTGTTTTACGAATCGAGAGCAGCATATACCAGCAGCCATATATTGGAAGAATCACTGGCCAAAATCTTGACTGATTTCTATATTCTGGCTGGAAGATTCATCAAGAATGACGATCTGGTCGATTGCAGCGACCAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781261.1
MKVEKLSCKLIKPHTPTPQNLKNYKLSLIDKYEAAMNFAVVLFYESRAAYTSSHILEESLAKILTDFYILAGRFIKNDDLVDCSDQGAAFVEADAPGTELIDLVPKIEIDQLNCLLRDQHFRFDEAPDNPLLSIQATRFPCGGVAIAVSVSHRVFDASSLGTFVAAWSSTANLNRKVEMSIDASFHLPSLLPCRNPDSSGLSRPNPEERENIVVKRLLFNKAALTSLKSRVRRKGKGKIVSEVRVVCATIARALIRLDRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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