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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000050`

染色体: Chr08 坐标: 306275-307926 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000050`
名称	SmilChr08G000050
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	306275 - 307926 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999674`
GeneID	`130999674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999674`
原始查询	`SmilChr08G000050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=31.9; qcov=1.05; evalue=2.89e-66; confidence=low
Rice	`Os08g0543400` - identity=30.1; qcov=0.912; evalue=1.05e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781262.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781262.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781262.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781262.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781262.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:306723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B14,B73,C72
`Chr8:306801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B13,B38,B39
`Chr8:306805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	70	A13,A15,A16,A19,A2,A23,A24,A25,A4,B106,B107,B115,B119,B123,B126,B134,B16,B17,B23,B26,B29,B45,B50,B61,B62,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B80,B88,B89,B95,C1,C11,C12,C18,C21,C22,C28,C29,C30,C32,C36,C39,C44,C45,C46,C48,C49,C50,C55,C57,C59,C64,C66,C69,C73,C78,C79,C80,C87,D10,D2,D6,D9
`Chr8:306816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C27,C7
`Chr8:306820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	B115,B123,B132,B26,B28,B36,B6,B74,B77,B80,B82,C16,C25,C26,C29,C31,C41,C48,C5,C67,C7,C76,C77,C80,D8
`Chr8:306825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:306830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,B59
`Chr8:306837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B113,B65,C87,D10
`Chr8:306845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C10,C15
`Chr8:306895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:306907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:306908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B30,B91,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781262.1

411 aa

206

411

Transferase

PF02458 Transferase 3-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781262.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	3	405	9.9e-68	229.5	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925279.1
ATAAATTCTTAGCATTTGTCCAATTTCTATAAACATGACTAATATCAAAATAATCAGCAAAAAATTGATAAAACCGTGCATCCCAACACCTCAAAATCTCAAGAACTACAAATTATCATTTCTAGATGAGATTAGCCCACAAATGCAAGTTGGGGTCGTTTTATTCTATCCATCAAAAGAAAAAAATTCCCATTTGGAAGAATCATTGGCCAAAATCTTGGTTCAATTCTACCCTCTTGCCGGAAGATTCGTCGAGAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999674
ATGACTAATATCAAAATAATCAGCAAAAAATTGATAAAACCGTGCATCCCAACACCTCAAAATCTCAAGAACTACAAATTATCATTTCTAGATGAGATTAGCCCACAAATGCAAGTTGGGGTCGTTTTATTCTATCCATCAAAAGAAAAAAATTCCCATTTGGAAGAATCATTGGCCAAAATCTTGGTTCAATTCTACCCTCTTGCCGGAAGATTCGTCGAGAACGATCTCATGGTCGACTGCAGCGACCAGGGCGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781262.1
MTNIKIISKKLIKPCIPTPQNLKNYKLSFLDEISPQMQVGVVLFYPSKEKNSHLEESLAKILVQFYPLAGRFVENDLMVDCSDQGAQFVEAEAPDVELLDLIVERNLEKLHFLSPREAIDPLLSIQITSFKCGGVALAVSVPHRIFDASSLATFITAWSSAGKIIICPCFDAASWFPARNHQGKGRGIEASRSIVKKFPFKKEALASLRSISRVSRVSRVCAVTAVIARALIGLDRAKREGESRPSIIVQAVNIRERTIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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