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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000081`

染色体: Chr08 坐标: 467499-469991 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000081`
名称	SmilChr08G000081
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	467499 - 469991 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996994`
GeneID	`130996994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996994`
原始查询	`SmilChr08G000081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=34.3; qcov=0.985; evalue=7.09e-107; confidence=low
Rice	`Os09g0479500` - identity=27.7; qcov=0.997; evalue=9.49e-64; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057778258.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778258.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778258.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778258.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:467501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C33
`Chr8:467510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B93,C9
`Chr8:467554`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C29
`Chr8:467554`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C29
`Chr8:467666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr8:467687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr8:467717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr8:467757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C68
`Chr8:467826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B9,C57
`Chr8:467837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C32,C68,D10
`Chr8:467839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B22,B9,C57
`Chr8:467841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B139,C52,C6,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778258.1

779 aa

390

779

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 29-198 aa PF23559 WHD_DRP 281-354 aa PF23598 LRR_14 428-748 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778258.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	29	198	5.4e-36	124.5	NB-ARC domain
`XP_057778258.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	281	354	1.3e-09	38.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057778258.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	428	748	1.4e-22	80.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922275.1
ATGCCAATTCAGCATATACCTTCACCATTATTTGAGCAATGGAATGAGAGAGTTAAGGTCCAAAAGATTAACGAAAATGCCCCAAATATTGCCAAAAAGCTCCTAGTGGAAGACGAAAAGCATCGAGTAATTTCAGTGTGGGGAATGGGGGGATCAGGCAAGACCACCATTGCCAAAAAGCTCTACAACGAGAACAGCACCAGCTTTGATCTTTGCGCGTGGGTTTGCATTAGTCAGCAATGTCAGAGTTTTCGATCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996994
ATGCCAATTCAGCATATACCTTCACCATTATTTGAGCAATGGAATGAGAGAGTTAAGGTCCAAAAGATTAACGAAAATGCCCCAAATATTGCCAAAAAGCTCCTAGTGGAAGACGAAAAGCATCGAGTAATTTCAGTGTGGGGAATGGGGGGATCAGGCAAGACCACCATTGCCAAAAAGCTCTACAACGAGAACAGCACCAGCTTTGATCTTTGCGCGTGGGTTTGCATTAGTCAGCAATGTCAGAGTTTTCGATCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778258.1
MPIQHIPSPLFEQWNERVKVQKINENAPNIAKKLLVEDEKHRVISVWGMGGSGKTTIAKKLYNENSTSFDLCAWVCISQQCQSFRSVWEDVLMQLQHQNTKDGPKIREDVTSLSEWELKERLCKIQREKRCLIVFDDLWKVSDWDDFKHPFLVQGLQSKILITTRKREVAEIGCPVKLGLLKEEDALELLKNKAFPHTNIPEFALEENVEKIGKEMVKKCGYLPLAVCLLGGVLRKTNSMMEWKLVKEFIYRDEKEIDGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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