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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000095`

染色体: Chr08 坐标: 579953-580819 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000095`
名称	SmilChr08G000095
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	579953 - 580819 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996998`
GeneID	`130996998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996998`
原始查询	`SmilChr08G000095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=33.2; qcov=0.962; evalue=2.05e-31; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=28.8; qcov=0.858; evalue=1.31e-15; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778262.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778262.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778262.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778262.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778262.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:579971`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A15,B110,B115,B13,B15,B30,B50,B52,B59,B64,B82,B95,C1,C14,C40,C48,C50,C68,C77,D4,D5
`Chr8:579973`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	36	A14,A15,A16,B103,B110,B115,B13,B17,B50,B52,B57,B59,B64,B66,B68,B75,B78,B79,B82,B87,B93,B94,C1,C14,C40,C48,C50,C55,C65,C68,C7,C77,C79,D2,D4,D5
`Chr8:579976`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B122,B32
`Chr8:579976`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B122,B32
`Chr8:580001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:580019`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B15,B82,C55,C59
`Chr8:580019`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B15,B82,C55,C59
`Chr8:580026`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B15,B82,C55,C59
`Chr8:580026`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B15,B82,C55,C59
`Chr8:580040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr8:580048`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C9
`Chr8:580048`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778262.1

288 aa

144

288

LRR_14

PF23598 LRR_14 2-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778262.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	2	257	4.1e-13	49.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922279.1
ATGGATACCCTTGATTTAACTTATTCGAGGAATGTTGGAGTTCCAAATGTTTTTAAGGAAATGGTACTTTTAAAGCACTTGTTTCTTCCCGATTATGATGAGGAAAATATTGGAAGTTATCGACTAACATTGGACGAGGGAGTGGTTGAGTTGGAGACCCTATGGAAGTTGGATAGTAGAGTGCATGAATTAAAATGTATGAACAGAATGAAGAATCTGCGAACTTTCTCAACAAACATACACGACAATGAAAGCTTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996998
ATGGATACCCTTGATTTAACTTATTCGAGGAATGTTGGAGTTCCAAATGTTTTTAAGGAAATGGTACTTTTAAAGCACTTGTTTCTTCCCGATTATGATGAGGAAAATATTGGAAGTTATCGACTAACATTGGACGAGGGAGTGGTTGAGTTGGAGACCCTATGGAAGTTGGATAGTAGAGTGCATGAATTAAAATGTATGAACAGAATGAAGAATCTGCGAACTTTCTCAACAAACATACACGACAATGAAAGCTTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778262.1
MDTLDLTYSRNVGVPNVFKEMVLLKHLFLPDYDEENIGSYRLTLDEGVVELETLWKLDSRVHELKCMNRMKNLRTFSTNIHDNESLSANIDAIALMEKLVYCWVVIKKGCELGTNKGVLTLKKVITCPNLHSLWIEVKLGKVLAECGSDFISSKLRSLYLSECEIEDDPMGILGKLPCLIELYLWTKSFVGEEMTCPSDSFPRLKLLELYQLPKLREWRVEAGAMPLLYELEIYDCSSLKMLPHGLSGISTLRKLKISKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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