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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000113`

染色体: Chr08 坐标: 710729-713875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000113`
名称	SmilChr08G000113
描述	2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	710729 - 713875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999734`
GeneID	`130999734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999734`
原始查询	`SmilChr08G000113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)-like
产物	2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)-like
Arabidopsis	`AT5G16990` (AT5G16990) Zinc-binding dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831562] identity=68; qcov=0.89; evalue=1.25e-171; confidence=high
Rice	`Os04g0497000` (OsNADPH1) - identity=65.7; qcov=0.89; evalue=8.73e-164; confidence=high
GO	GO:0032440 (2-alkenal reductase [NAD(P)H] activity)
KEGG	-
Pfam	PF00107 (ADH_zinc_N); PF13602 (ADH_zinc_N_2); PF16884 (ADH_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781337.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781337.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781337.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781337.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781337.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:710758`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A11,A21,A4,A5,B1,B102,B104,B111,B113,B12,B136,B137,B139,B28,B33,B50,B54,B66,B72,B85,B9,B98,B99,C14,C35,C50,C62,C63,C71,C8,C87,D2
`Chr8:710765`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B101,C64,C66
`Chr8:710765`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B101,C64,C66
`Chr8:710770`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A13,B128,B20,B23,B61,B62,B8,B95,C1,C31,C37,C4,C40,C72,D11
`Chr8:710772`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A18,A25,A4,B100,B123,B134,B135,B17,B60,B70,B71,B73,B80,C18,C19,C22,C3,C36,C46,C50,C59,C80,C86,D10,D9
`Chr8:710779`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	153	A1,A10,A11,A16,A19,A2,A20,A21,A24,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B119,B12,B121,B122,B13,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B139,B14,B15,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B34,B40,B41,B43,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B62,B64,B65,B66,B67,B72,B74,B75,B76,B78,B8,B82,B85,B86,B88,B89,B9,B91,B96,B97,B98,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C30,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C43,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C71,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D7,D8
`Chr8:710787`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	103	A10,A16,A18,A22,A25,A4,A7,A8,B100,B107,B109,B110,B114,B115,B118,B120,B123,B124,B126,B131,B133,B134,B135,B138,B14,B17,B19,B2,B24,B26,B3,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B5,B56,B58,B6,B60,B63,B64,B66,B68,B70,B71,B73,B75,B77,B80,B83,B86,B88,B90,B96,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C24,C25,C26,C27,C3,C33,C36,C41,C42,C44,C46,C47,C49,C50,C52,C53,C56,C58,C59,C6,C62,C63,C65,C67,C68,C7,C70,C77,C78,C80,C83,C85,C86,D1,D7,D9
`Chr8:710813`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A1,A16,A3,A9,B100,B112,B13,B133,B138,B14,B15,B2,B33,B46,B47,B76,B78,B89,C12,C20,C23,C30,C32,C37,C58,C68,C77,C78,C81,C84,C85
`Chr8:710817`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A2,B101,B103,B109,B111,B131,B18,B21,B30,B31,B34,B40,B42,B43,B53,B54,B56,B63,B65,B75,B8,B82,B96,C13,C15,C17,C24,C27,C4,C40,C52,C53,C64,C66,C79,D8
`Chr8:710844`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A14,A18,A24,A25,A4,A5,A7,A9,B100,B102,B114,B117,B119,B123,B126,B13,B132,B20,B3,B44,B45,B47,B55,B56,B62,B80,B88,B95,B96,B99,C1,C19,C2,C28,C34,C48,C52,C56,C61,C62,C64,C65,C66,C7,C74,C78,D1,D2,D5
`Chr8:710917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:710930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B79,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781337.1

383 aa

192

383

ADH_N_2

ADH_zinc_N

ADH_zinc_N_2

PF16884 ADH_N_2 48-152 aa PF00107 ADH_zinc_N 205-338 aa PF13602 ADH_zinc_N_2 239-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781337.1`	Pfam	`PF16884`	ADH_N_2	Family	48	152	2.6e-24	85.9	N-terminal domain of oxidoreductase
`XP_057781337.1`	Pfam	`PF00107`	ADH_zinc_N	Domain	205	338	9.1e-24	84.6	Zinc-binding dehydrogenase
`XP_057781337.1`	Pfam	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	Domain	239	378	3.1e-10	41.8	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925354.1
AAATGATCATCACAAGTTACAAAAGGAACCATCCAAGAAAAATTAAAAAAAAACACACAACACACAGAAAGAGTTCAAGAAAGAAGAAGAAAAAACACACACAACACACACTGCAGAAAATGGGAGAGGAAATGAGAAATCAGCAGATTATACTGAACAACTACGTGAAGGGCTCTGTGAGTGAATCCGACATGTCGTTGAGGAATTCCACCATCATCTCGAAGATTCCAAACGGCTGCGACGGCGCCGTTTTGGTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999734
ATGATCATCACAAGTTACAAAAGGAACCATCCAAGAAAAATTAAAAAAAAACACACAACACACAGAAAGAGTTCAAGAAAGAAGAAGAAAAAACACACACAACACACACTGCAGAAAATGGGAGAGGAAATGAGAAATCAGCAGATTATACTGAACAACTACGTGAAGGGCTCTGTGAGTGAATCCGACATGTCGTTGAGGAATTCCACCATCATCTCGAAGATTCCAAACGGCTGCGACGGCGCCGTTTTGGTGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781337.1
MIITSYKRNHPRKIKKKHTTHRKSSRKKKKKHTQHTLQKMGEEMRNQQIILNNYVKGSVSESDMSLRNSTIISKIPNGCDGAVLVKNLYLSCDPYMLSRMKEIEDNYAGSFKPGSPMNGYGVSKVLDSSHTDYKKGDLIWGMTGWEEYTLIKDLVDVFKIQDTDVPLSYYTGLLGMPGITAYVGFFELCSPKKGETIFISAASGAVGQLVGQFAKLTGCYVVGSAGSNEKVDLLKNKFGFDEAFNYKEEQDYSAALKRYF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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