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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000114`

染色体: Chr08 坐标: 714190-716784 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000114`
名称	SmilChr08G000114
描述	60S ribosomal protein L2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	714190 - 716784 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999735`
GeneID	`130999735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999735`
原始查询	`SmilChr08G000114`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L2, mitochondrial
产物	60S ribosomal protein L2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G44065` (AT2G44065) Ribosomal protein L2 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819012] identity=61.7; qcov=0.98; evalue=5.12e-78; confidence=high
Rice	`Os12g0567700` (rpl2) - identity=39; qcov=0.576; evalue=4.35e-16; confidence=low
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0015934 (large ribosomal subunit); GO:0016740 (transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03947 (Ribosomal_L2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057781338.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781338.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781338.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781338.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:714421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B126,B135,C52
`Chr8:714421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B135,C52
`Chr8:714441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C51,D4
`Chr8:714442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:714498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B62,C50
`Chr8:714630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B105,C59
`Chr8:714632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C58,C80,D11
`Chr8:716014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C29
`Chr8:716060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,D5
`Chr8:716099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:716121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B118,B82
`Chr8:716204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781338.1

205 aa

102

205

Ribosomal_L2_C

PF03947 Ribosomal_L2_C 57-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781338.1`	Pfam	`PF03947`	Ribosomal_L2_C	Domain	57	178	2.3e-51	173.8	Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925355.1
AACGACATCGTTTTGCTGGGATTCAGAAACCCTTCAAATGGCAAAAACCCCCCATTTCGTCTGAGTTGACACGAGCAGAAAAATGGCGCTCTTTAGAGCTCGAGCTGTCTCCTCCTCTCTCTTTCGCTCATGTCTCCTTGCTCCTTCTCGGTTTCTCTCTACTGGTGCCGGCGAGATGGTGGAATCGAAAGAAGTGCCGTCGTTGAAGTCGATGATGAACCAAATGCTGACTCTTGACATAAGTTCTCAATATGGGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999735
ATGGCGCTCTTTAGAGCTCGAGCTGTCTCCTCCTCTCTCTTTCGCTCATGTCTCCTTGCTCCTTCTCGGTTTCTCTCTACTGGTGCCGGCGAGATGGTGGAATCGAAAGAAGTGCCGTCGTTGAAGTCGATGATGAACCAAATGCTGACTCTTGACATAAGTTCTCAATATGGGAGCTGTATGCCTCTGTCAAATATGCGAATCGGTATGCAAATTCACAACATTGAGCTCCGCCCGGGGCAAGGTGGGAAGCTCGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781338.1
MALFRARAVSSSLFRSCLLAPSRFLSTGAGEMVESKEVPSLKSMMNQMLTLDISSQYGSCMPLSNMRIGMQIHNIELRPGQGGKLVRAAGTSAKILTEPNRSVRYCEIKLPSGEKRLIDKRCRATIGAVSNPEHGMKKLRKAGQSRWRGIRPTVRGVAMNPIDHPHGGGEGKSKSSGSHGQCSRTPWGKPTKSGYKTAKIKKRKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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