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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000123`

染色体: Chr08 坐标: 774580-778528 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000123`
名称	SmilChr08G000123
描述	cysteine synthase, chloroplastic/chromoplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	774580 - 778528 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999745`
GeneID	`130999745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999745`
原始查询	`SmilChr08G000123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine synthase, chloroplastic/chromoplastic-like
产物	cysteine synthase%2C chloroplastic/chromoplastic-like
Arabidopsis	`AT2G43750` (OASB) O-acetylserine (thiol) lyase B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818978] identity=81.7; qcov=0.865; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0978100` - identity=81.4; qcov=0.852; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004124 (cysteine synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006535 (GO:0006535); GO:0009567 (double fertilization forming a zygote and endosperm); GO:0009860 (pollen tube growth)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01320 (Sulfur cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00291 (PALP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781346.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057781346.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781346.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781346.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:775235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,D9
`Chr8:775778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:775793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B19,B63,C9,D8
`Chr8:775816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D5
`Chr8:777104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A15,B12,B68,B71,B80,B89,C11,C69,D10
`Chr8:777143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C84
`Chr8:777160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:778304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B82
`Chr8:778399`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A18,A2,A23,A6,B102,B103,B107,B109,B111,B112,B119,B122,B124,B133,B19,B26,B37,B48,B50,B52,B53,B59,B66,B72,B76,B79,B85,B90,B92,B97,C1,C16,C26,C28,C29,C3,C33,C34,C36,C63,C70,C8,C82,C9,D1,D11,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781346.1

392 aa

196

392

PALP

PF00291 PALP 79-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781346.1`	Pfam	`PF00291`	PALP	Family	79	360	1.4e-74	251.8	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925363.1
TACCACGCAGTATACACACAGTGAAGGTGTGAGAAATAGTGATGAGAGAGAGAGTGAGAGAATAAAATATCATATGTGAAGCCACAAAAATCTCTATGCTTTCTGACACAAAATCGCACACAGTGGCATGACAATGGCGACGCTGGCGAAAATTCCGTTGACTTTTCTGTGTGCCGCCGACAGCTCGGAGCTCTGCTCGCCTAAATTCTCCACTGCTAGGCGATCTCTCGGAGCTAGAACGCTAGCCTATGAGAATGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999745
ATGACAATGGCGACGCTGGCGAAAATTCCGTTGACTTTTCTGTGTGCCGCCGACAGCTCGGAGCTCTGCTCGCCTAAATTCTCCACTGCTAGGCGATCTCTCGGAGCTAGAACGCTAGCCTATGAGAATGCCGATAGAATGAGAATCGGCTGCGGTAGTAGGTGCGGAATTGTGTGTAAAGCGGTATCGGTCGAGCCGCAGGCGGCGATTGAAGGTCTCAACATTGCTGAAGATGTTAGCCAGCTTATTGGGAAGACGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781346.1
MTMATLAKIPLTFLCAADSSELCSPKFSTARRSLGARTLAYENADRMRIGCGSRCGIVCKAVSVEPQAAIEGLNIAEDVSQLIGKTPMVYLNNIVKGCVANVSAKLEIMEPCCSVKDRIGYSMIADAEKRGLITPGKSVLVEATSGNTGIGLAFIAASKGYKLILTMPTSMSLERKVLLKAFGAKLVLTDAAKGVNGALQKAEEILNSTPNAYMLGQFDNPANPQIHYETTGPEIWEDTKGKVDILVAGIGTGGTISGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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