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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000142`

染色体: Chr08 坐标: 917560-919488 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000142`
名称	SmilChr08G000142
描述	uncharacterized SmilChr08G000142
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	917560 - 919488 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997000`
GeneID	`130997000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997000`
原始查询	`SmilChr08G000142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	selenoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837079]; symbol=AT1G05720; hit=AT1G05720; species=arabidopsis; confidence=high
产物	selenoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837079]; symbol=AT1G05720; hit=AT1G05720; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G05720` (AT1G05720) selenoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837079] identity=79.8; qcov=0.945; evalue=1.03e-61; confidence=high
Rice	`Os01g0894500` (P0696G06.11) - identity=75; qcov=0.909; evalue=3.54e-53; confidence=high
GO	GO:0005788 (endoplasmic reticulum lumen); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF08806 (Sep15_SelM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057778264.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778264.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057778264.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778264.1`
5	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057778264.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:917787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr8:917804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,D11
`Chr8:917807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C20,C48,C52,D11
`Chr8:917822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C20,C48
`Chr8:917825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:917846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C66
`Chr8:917903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:917933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C63,C81
`Chr8:917945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C41,C43,C63
`Chr8:918240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778264.1

110 aa

110

Sep15_SelM

PF08806 Sep15_SelM 31-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778264.1`	Pfam	`PF08806`	Sep15_SelM	Domain	31	105	2.3e-29	102.0	Sep15/SelM redox domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922281.1
ATGGGATCTTTGAAATGGGAGCTGGTGTCTGATTGTCTGAAGTGTTGCGCTGAGGATTCAGACGATGCGACAAGCAAGGTTATATATTCTGGTGCGATTTTAGAGGTGTGCATGAGGAAATTGGTGTTTTATCCCGAGCTAGTCGGCTTTATAGAGGAAGAGAAGGATAAATTCCCATCGGTCAAAGTTCAATACGCGTTCAATTCTCCGCCCAAGTTGATCATGTTGGATGACGACGGGCAGCTTAAGGAAACCATTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997000
ATGGGATCTTTGAAATGGGAGCTGGTGTCTGATTGTCTGAAGTGTTGCGCTGAGGATTCAGACGATGCGACAAGCAAGGTTATATATTCTGGTGCGATTTTAGAGGTGTGCATGAGGAAATTGGTGTTTTATCCCGAGCTAGTCGGCTTTATAGAGGAAGAGAAGGATAAATTCCCATCGGTCAAAGTTCAATACGCGTTCAATTCTCCGCCCAAGTTGATCATGTTGGATGACGACGGGCAGCTTAAGGAAACCATTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778264.1
MGSLKWELVSDCLKCCAEDSDDATSKVIYSGAILEVCMRKLVFYPELVGFIEEEKDKFPSVKVQYAFNSPPKLIMLDDDGQLKETIRVDNWKREHILQFLKEKVKPSSDT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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