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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000148`

染色体: Chr08 坐标: 962305-964094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000148`
名称	SmilChr08G000148
描述	BAG-associated GRAM protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	962305 - 964094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997004`
GeneID	`130997004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997004`
原始查询	`SmilChr08G000148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BAG-associated GRAM protein 1-like
产物	BAG-associated GRAM protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G59660` (AT3G59660) C2 domain-containing protein / GRAM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825135] identity=63.1; qcov=0.969; evalue=2.05e-97; confidence=high
Rice	`Os09g0516900` - identity=58.9; qcov=0.913; evalue=6.35e-95; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16016 (VASt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778267.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778267.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057778267.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778267.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778267.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:962511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr8:962633`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A19,B76,C12,C55,C87,D4
`Chr8:962638`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A19,B76,C12,C55,C87,D4
`Chr8:962674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B76,C55,C87,D4
`Chr8:962678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr8:963108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B38,C5,C67
`Chr8:963120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B32,B58,B95,C37
`Chr8:963267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C71
`Chr8:963747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr8:963759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B53,B80,B82,C48
`Chr8:963930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778267.1

229 aa

114

229

VASt

PF16016 VASt 46-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778267.1`	Pfam	`PF16016`	VASt	Domain	46	191	2.4e-32	113.1	VAD1 Analog of StAR-related lipid transfer domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922284.1
ATGACATCTACTTTCCTCAATGATTATAATGACCAGAGCATCAGAGGCAGCAATAGGCAGTCTAAGATTTCTGAGCAGAGTGTGGCAAAGACTGAAAAATCACAGCCATTCATCAAGGAGGAAGTGCTTTTGGAAATTTACAATGACATGTTCCCGTGCACAGCGGAGCAATTTTTCAAGCTTTTGTTAGATGATGATTCAACCTATACAAATGAGTATCGTAATGTCCGGAAGGATTCCAACCTCATAATGGGTCAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997004
ATGACATCTACTTTCCTCAATGATTATAATGACCAGAGCATCAGAGGCAGCAATAGGCAGTCTAAGATTTCTGAGCAGAGTGTGGCAAAGACTGAAAAATCACAGCCATTCATCAAGGAGGAAGTGCTTTTGGAAATTTACAATGACATGTTCCCGTGCACAGCGGAGCAATTTTTCAAGCTTTTGTTAGATGATGATTCAACCTATACAAATGAGTATCGTAATGTCCGGAAGGATTCCAACCTCATAATGGGTCAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778267.1
MTSTFLNDYNDQSIRGSNRQSKISEQSVAKTEKSQPFIKEEVLLEIYNDMFPCTAEQFFKLLLDDDSTYTNEYRNVRKDSNLIMGQWHSADEYDGQVREITFRSVCNSPMCPPDTAMTEWQHAVLSADKKKLVFETVQQAHDVPFGSYFEIHCRWSLESNSESSCTINIRVGAHFKKWCVMQSKIKSGAINEYKKEVEMMLDVARSYIQRKTSKTETTPSPPNVVQESR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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