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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000162`

染色体: Chr08 坐标: 1091219-1093559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000162`
名称	SmilChr08G000162
描述	probable disease resistance protein At4g27220
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1091219 - 1093559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997015`
GeneID	`130997015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997015`
原始查询	`SmilChr08G000162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At4g27220
产物	probable disease resistance protein At4g27220
Arabidopsis	`AT4G27220` (AT4G27220) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828830] identity=27.4; qcov=0.631; evalue=2.17e-19; confidence=low
Rice	`Os01g0788500` - identity=32.7; qcov=0.29; evalue=1.46e-16; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13855 (LRR_8); PF23247 (LRR_RPS2); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057778277.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778277.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057778277.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778277.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1091381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr8:1091395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:1091604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C15,D4
`Chr8:1091605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B20,C29
`Chr8:1091641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr8:1091649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:1091651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B101,B89,C28
`Chr8:1091735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:1091757`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A7,B133,B76
`Chr8:1091757`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A7,B133,B76
`Chr8:1091776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C24,C25,C39,C49
`Chr8:1091797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C3,C50,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778277.1

718 aa

359

718

LRR_14

LRR_8

LRR_RPS2

PF23598 LRR_14 183-491 aa PF13855 LRR_8 200-258 aa PF23247 LRR_RPS2 508-582 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778277.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	183	491	4.5e-17	62.6	Leucine-rich repeat region
`XP_057778277.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	200	258	2.9e-11	43.7	Leucine rich repeat
`XP_057778277.1`	Pfam	`PF23247`	LRR_RPS2	Repeat	508	582	1.6e-14	54.9	Plant disease resistance protein RPS2-like, leucine-rich repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922294.1
ATGATTAGCCCCACTTCAGAAAGGTCCGGCGGCGGCGGTGAAACTCGTGAGGCTGTCGAATCTCCTCACGTGCATGATGTTGTGACTTCGCAAGTCCAAGAATATGAGAACAAATGGGATGCACCAAAAGTGCTCGGTGTTGTGACTTCACAAATCCAAGAACATGAGAACAAATCGAAAGAACCAAAATATGAAAAGATGACATCGAATCCACCAGAGGTGAGCAAACACCAGCAAGATCAAAGTGTTGATGATATTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997015
ATGATTAGCCCCACTTCAGAAAGGTCCGGCGGCGGCGGTGAAACTCGTGAGGCTGTCGAATCTCCTCACGTGCATGATGTTGTGACTTCGCAAGTCCAAGAATATGAGAACAAATGGGATGCACCAAAAGTGCTCGGTGTTGTGACTTCACAAATCCAAGAACATGAGAACAAATCGAAAGAACCAAAATATGAAAAGATGACATCGAATCCACCAGAGGTGAGCAAACACCAGCAAGATCAAAGTGTTGATGATATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778277.1
MISPTSERSGGGGETREAVESPHVHDVVTSQVQEYENKWDAPKVLGVVTSQIQEHENKSKEPKYEKMTSNPPEVSKHQQDQSVDDIGFARVGESELGMTFKFVLSMSESEGLNIRLQTLSMSSRQTQETALNLGTAMDNYRLFSATREVAVLDKNGVIVNRNGSKQPREMPTAEEWGEARVVNLIERKNMLLNDEAPNCPNLLILFLQRNSRLTRIPSSFFDEMPRLNFLDLSYTRIKTLPGSLFKLKNLQILLLRSCVC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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