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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000169`

染色体: Chr08 坐标: 1167800-1173042 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000169`
名称	SmilChr08G000169
描述	eukaryotic translation initiation factor 2A
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1167800 - 1173042 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999783`
GeneID	`130999783`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999783`
原始查询	`SmilChr08G000169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 2A
产物	eukaryotic translation initiation factor 2A
Arabidopsis	`AT1G73180` (AT1G73180) Eukaryotic translation initiation factor eIF2A family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843652] identity=68.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0606100` - identity=60.7; qcov=0.217; evalue=1.06e-22; confidence=weak
GO	GO:0000049 (tRNA binding); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006413 (translational initiation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF08662 (eIF2A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999783

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781404.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057781404.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781404.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781404.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781404.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1168201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C49,C87
`Chr8:1168207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B97,C25,C39,C60
`Chr8:1168210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B97,C25,C39,C60
`Chr8:1168218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B67,D11
`Chr8:1169310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C19
`Chr8:1169512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B67,D11
`Chr8:1169665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C49,C87
`Chr8:1169684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B113,B132,C71,C87
`Chr8:1169697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B113,B132,C71,C87
`Chr8:1169860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:1169976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:1170673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781404.1

515 aa

258

515

eIF2A

PF08662 eIF2A 216-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781404.1`	Pfam	`PF08662`	eIF2A	Repeat	216	409	4.5e-80	268.9	Eukaryotic translation initiation factor eIF2A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093585.1
CTTGACTCCACACTCCACACTATTCAACACTAAAAATTGAGTCTTGAAGGGTTTCAACGAAAAAAATTGAGTCTTGAATTTTCTCAAAAAAAAAAAATCGAGTCTTGAAAGAACTGTTAAACCCTAATTGCAGAGAAGCTTTCACAGTCATCAATGGCGGTTGCAAATCCTCCATCGCTAGACATCTTAGTGAGAGATCATGGGGGTTTTACTATCTGGAGCGGCCCCCCTTTCAGCAATGGGGAGCCCAAAATTAAGCT...

XR_009093584.1
ACTAAAAATTGAGTCTTGAAGGGTTTCAACGAAAAAAATTGAGTCTTGAATTTTCTCAAAAAAAAAAAATCGAGTCTTGAAAGAACTGTTAAACCCTAATTGCAGAGAAGCTTTCACAGTCATCAATGGCGGTTGCAAATCCTCCATCGCTAGACATCTTAGTGAGAGATCATGGGGGTTTTACTATCTGGAGCGGCCCCCCTTTCAGCAATGGGGAGCCCAAAATTAAGCTCGATAAAGTTCCCTGCAACTCCACAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999783
ATGGCGGTTGCAAATCCTCCATCGCTAGACATCTTAGTGAGAGATCATGGGGGTTTTACTATCTGGAGCGGCCCCCCTTTCAGCAATGGGGAGCCCAAAATTAAGCTCGATAAAGTTCCCTGCAACTCCACAAAATTCAGCGACGATGGATCCAAGCTCATGGCTATTCGGTCCGATTCCTTAATTACCGTCTACGATGCCAAGAATTTGGTGGAAATTAGGGGTTTTCAAGTCCCCAATCTTCTCGCTGCCAGCATATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781404.1
MAVANPPSLDILVRDHGGFTIWSGPPFSNGEPKIKLDKVPCNSTKFSDDGSKLMAIRSDSLITVYDAKNLVEIRGFQVPNLLAASISPCGTYVQTFQKSSTPQVKNVVLWKTETGESVYQAFQKNMTKATWPSIRFSSDEAVACRLATNEVQFFDAGDFSKGVVHRLRVQGIAAFELSKSPGSYVAVFVPESKGMPANVQIFSCAKESQSQPVARKSFFRCSSVQLHWNHGSKGLLIVVQSDVDKTNQSYYGETKLNYLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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