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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000178`

染色体: Chr08 坐标: 1208787-1209944 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000178`
名称	SmilChr08G000178
描述	chitinase 6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1208787 - 1209944 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997021`
GeneID	`130997021`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997021`
原始查询	`SmilChr08G000178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chitinase 6-like
产物	chitinase 6-like
Arabidopsis	`AT3G54420` (EP3) homolog of carrot EP3-3 chitinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824608] identity=63.3; qcov=0.715; evalue=3.17e-54; confidence=high
Rice	`Os02g0605900` (Cht6) - identity=55.5; qcov=0.866; evalue=2.01e-60; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0006032 (chitin catabolic process); GO:0016998 (cell wall macromolecule catabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00182 (Glyco_hydro_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997021

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057778283.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057778283.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778283.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778283.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778283.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1208832`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,B115,B124
`Chr8:1208832`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A3,B115,B124
`Chr8:1209006`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B49,B62,B78,C26
`Chr8:1209006`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B49,B62,B78,C26
`Chr8:1209026`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	62	A11,A18,A23,A25,A4,A5,B10,B101,B104,B107,B114,B118,B122,B126,B128,B129,B136,B15,B17,B18,B21,B24,B26,B27,B28,B31,B39,B4,B40,B42,B49,B6,B7,B84,B85,B9,B94,C2,C22,C24,C25,C28,C32,C38,C41,C45,C46,C47,C5,C50,C52,C55,C67,C68,C70,C76,C78,D1,D3,D5,D7,D8
`Chr8:1209038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	60	A11,A18,A23,A25,A4,A5,B10,B101,B104,B107,B114,B121,B122,B126,B128,B129,B136,B15,B17,B21,B23,B24,B26,B27,B28,B31,B39,B4,B40,B42,B49,B6,B7,B84,B85,B9,B94,C22,C24,C25,C28,C32,C38,C41,C45,C46,C47,C5,C50,C55,C67,C68,C70,C76,C78,D1,D3,D5,D7,D8
`Chr8:1209040`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	76	A14,A15,A18,A25,A3,A5,A9,B103,B113,B114,B117,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B134,B135,B136,B139,B14,B2,B21,B24,B32,B34,B37,B38,B40,B42,B46,B47,B50,B58,B63,B64,B66,B82,B85,B92,B99,C11,C15,C16,C24,C25,C28,C31,C33,C34,C42,C44,C46,C47,C49,C5,C51,C55,C6,C61,C67,C71,C72,C82,C87,C9,D4,D5,D6,D8
`Chr8:1209042`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	59	A11,A18,A23,A25,A4,A5,B10,B101,B104,B107,B114,B121,B122,B126,B128,B129,B136,B15,B17,B18,B21,B23,B24,B27,B28,B31,B4,B40,B42,B49,B6,B7,B84,B85,B9,B94,C2,C22,C24,C25,C28,C32,C38,C41,C45,C46,C47,C5,C52,C55,C67,C68,C70,C76,C78,D1,D3,D5,D7
`Chr8:1209054`	`GA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A22,A24,B69,B88,C21
`Chr8:1209060`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A14,A3,B103,B113,B114,B117,B121,B122,B124,B13,B130,B132,B134,B14,B34,B37,B4,B47,B50,B58,B66,B92,B99,C11,C16,C31,C33,C49,C72,C82,C87,C9,D6,D8
`Chr8:1209066`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A14,A3,B103,B106,B113,B114,B117,B121,B122,B124,B13,B130,B132,B134,B14,B34,B37,B4,B47,B50,B55,B58,B66,B92,B99,C11,C16,C31,C33,C49,C5,C51,C72,C82,C87,C9,D6,D8
`Chr8:1209071`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A14,A3,A9,B103,B106,B113,B114,B117,B121,B122,B124,B13,B130,B132,B134,B14,B34,B37,B4,B47,B50,B55,B58,B66,B92,B99,C11,C16,C31,C33,C49,C5,C51,C61,C72,C82,C87,C9,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778283.1

179 aa

179

Glyco_hydro_19

PF00182 Glyco_hydro_19 52-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778283.1`	Pfam	`PF00182`	Glyco_hydro_19	Domain	52	179	2.8e-37	129.5	Chitinase class I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922300.1
ATGACAGCTCGCTCCGACAGAGCTGCAGTTGGTCTCATTGAGTCTCTGCTGCTTCTTCTCTCGAGTCTGAGGGCTAGTATTCTGTCCCCAAATTTGTTTGAGACTGTCTCATGGGTCAAGATTCAGATTGAAACACTATATTGGAGTGTTTTTGGCCGATCTAGAAACTATTGCGACCAAAGCAACAGGCAGTGGCCGTGCGTGGCCGACAAGGGCTACTACGGCCAAGGCCCGTTGCAAATATCATGGAACTACAACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997021
ATGACAGCTCGCTCCGACAGAGCTGCAGTTGGTCTCATTGAGTCTCTGCTGCTTCTTCTCTCGAGTCTGAGGGCTAGTATTCTGTCCCCAAATTTGTTTGAGACTGTCTCATGGGTCAAGATTCAGATTGAAACACTATATTGGAGTGTTTTTGGCCGATCTAGAAACTATTGCGACCAAAGCAACAGGCAGTGGCCGTGCGTGGCCGACAAGGGCTACTACGGCCAAGGCCCGTTGCAAATATCATGGAACTACAACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778283.1
MTARSDRAAVGLIESLLLLLSSLRASILSPNLFETVSWVKIQIETLYWSVFGRSRNYCDQSNRQWPCVADKGYYGQGPLQISWNYNYGPAGQAIGFDGLNNPEIVARDAVISFKTALWFWMDSVHSAITSGKGFGATIRAINGDLEFKNANPGAVTSRVNYYTSYCSQLRVSPGPNLRC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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