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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000186`

染色体: Chr08 坐标: 1258615-1262088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000186`
名称	SmilChr08G000186
描述	transcription factor MYB4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1258615 - 1262088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999794`
GeneID	`130999794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999794`
原始查询	`SmilChr08G000186`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB4-like
产物	transcription factor MYB4-like
Arabidopsis	`AT3G23250` (MYB15) myb domain protein 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821904] identity=50.9; qcov=1.15; evalue=2.25e-84; confidence=high
Rice	`Os04g0517100` (OsMyb4) - identity=53.2; qcov=1.08; evalue=1.32e-84; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781422.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781422.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781422.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781422.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1258950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B80,B82,C48
`Chr8:1259578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C80
`Chr8:1259593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B49,D6
`Chr8:1259617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,D8
`Chr8:1259679`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A1,B12,C64,C66
`Chr8:1261330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B83,C48,C6
`Chr8:1261552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C82
`Chr8:1261560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:1261585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B135,B56,B96,C13
`Chr8:1261636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B83,C48,C6,D11
`Chr8:1261640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B60,B66
`Chr8:1261646`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A25,B134,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781422.1

245 aa

122

245

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-112 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781422.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	1.6e-37	128.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057781422.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	1.7e-23	83.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057781422.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	112	1.6e-37	128.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057781422.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	118	1.7e-23	83.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925439.1
TAGCTACTGTTGCATCTCTCAAGTGTGGATTAATTTAATCTAGAGAGAGAGAGAGAGATCCAATTTCCTGGAAACTGCCACCAAGGACTTGTTAAAACAAGAAAGATGCTGCCCTATGTCACAATTCAAGAGAGGATAAATACCCACCATTGGCATTTACAACACCTCTTATATTCCCTTGCTCAAACACAGAGAGGCTGTGTGTCTGTTTCCACAACCAATATTTGAAGCAAAATAAATCCCACAAAAAAAAAAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999794
ATGGTGAGAGCTCCTTGCTGTGAGAAAATGGGGCTGAAGAAAGGCCCATGGAGCCCTGAAGAAGACCAGATTTTGGTGTCTTATATTCAGAAACATGGCCATGGAAATTGGAGAGCACTCCCAAAACAATCTGGGCTGTTGAGATGTGGGAAGAGTTGCAGGCTGAGATGGATAAACTATTTGAGGCCAGATATTAAGAGGGGAAATTTCACTAAAGAAGAGGAAGAAGCCGTCATCAATTTACATGAAATGCTTGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781422.1
MVRAPCCEKMGLKKGPWSPEEDQILVSYIQKHGHGNWRALPKQSGLLRCGKSCRLRWINYLRPDIKRGNFTKEEEEAVINLHEMLGNRWSAIAARLPGRTDNEIKNVWHTHLKKKLKHYDESSQDSKRESTIQISKCDNNDVMENINNNLATTSLQRCSSEVSSVTDSSVEKVAVKEELDYSSEYFPTIDESFWSEELSNEDVSETNEFLPLVESVEDSKVNGGGMDFWYNLFIRAGDMPDLPEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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