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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000194`

染色体: Chr08 坐标: 1303194-1306064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000194`
名称	SmilChr08G000194
描述	11S globulin seed storage protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1303194 - 1306064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997022`
GeneID	`130997022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997022`
原始查询	`SmilChr08G000194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11S globulin seed storage protein 1-like
产物	11S globulin seed storage protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G44120` (CRA1) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834435] identity=43.6; qcov=0.957; evalue=6.85e-98; confidence=medium
Rice	`Os01g0762500` (Glua1*) - identity=44; qcov=0.949; evalue=1.57e-100; confidence=medium
GO	GO:0045735 (nutrient reservoir activity)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057778284.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057778284.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057778284.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778284.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778284.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1303195`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A18,B118,B123,B25,B26,B72,B89,C77,D10,D11
`Chr8:1303206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:1303207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B48,B76
`Chr8:1303244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D7
`Chr8:1303415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B23,C80
`Chr8:1303460`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C87
`Chr8:1303460`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C87
`Chr8:1304292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B135
`Chr8:1304364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C3
`Chr8:1304371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B113
`Chr8:1304398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:1304427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778284.1

393 aa

196

393

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 6-87 aa PF00190 Cupin_1 203-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778284.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	6	87	1.4e-53	181.3	Cupin
`XP_057778284.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	203	352	1.4e-53	181.3	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922301.1
TTGTCGAAAAATGCAGGCAGAGGACTGCTCGGAGTAGTGATTCCCGGCTGCGCCGAGACCTTCGAGACCGAGATGAGGCAGCGAGACCATGACCGGAGCAGGAGCTTCGTGGATCGGCACCAGAAGGTCCGCCAGTTCAGGCAAGGCGACGTTATCGCCTTGCCGGCCGGGTTCACTCTCTGGTTTTACAACAACGGCGACGAGAGGCTCGAGACCGTCGCGTTGCTCGACACCGGCAACCAAATCAACCAGCTCGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997022
TTGTCGAAAAATGCAGGCAGAGGACTGCTCGGAGTAGTGATTCCCGGCTGCGCCGAGACCTTCGAGACCGAGATGAGGCAGCGAGACCATGACCGGAGCAGGAGCTTCGTGGATCGGCACCAGAAGGTCCGCCAGTTCAGGCAAGGCGACGTTATCGCCTTGCCGGCCGGGTTCACTCTCTGGTTTTACAACAACGGCGACGAGAGGCTCGAGACCGTCGCGTTGCTCGACACCGGCAACCAAATCAACCAGCTCGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778284.1
LSKNAGRGLLGVVIPGCAETFETEMRQRDHDRSRSFVDRHQKVRQFRQGDVIALPAGFTLWFYNNGDERLETVALLDTGNQINQLDHAFRNFFLAGKXHEAQGSESYRSRRRGESEQSERDNIFNPFDDELLAEIFNVDIETARKLKSQDDFRGQIVQADRFDIVFPGHEEEERESRRRGRWWDNLEASNGLEETLCSARLRLNLDEPARADVYNPRGGRISAANSQKLPILSWLRLSAEKGVLYKNAIMAPTWNANAHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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