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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000198`

染色体: Chr08 坐标: 1327129-1328316 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000198`
名称	SmilChr08G000198
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1327129 - 1328316 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997023`
GeneID	`130997023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997023`
原始查询	`SmilChr08G000198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 1
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 1
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=32.9; qcov=0.916; evalue=3.07e-39; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=37.9; qcov=1; evalue=3.84e-52; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23247 (LRR_RPS2); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057778285.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778285.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778285.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778285.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1327156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A3,A5,B107,B111,B117,B125,B132,B29,B42,B85,C43,C63,C76,D4
`Chr8:1327157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B11,B118,B133,B15,B19,B22,B32,B33,B60,B72,B86,B87,B95,C32,C34,C51,C74
`Chr8:1327167`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B107,B111,B117,B29,B42,B85,C76,D4
`Chr8:1327169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B107,B111,B117,B125,B132,B29,B42,B85,C76,D4
`Chr8:1327206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B131,B140,C46
`Chr8:1327209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B39
`Chr8:1327225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C46,C51
`Chr8:1327227`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B73,B82,B98,C12,C15,C40,C59,C8
`Chr8:1327232`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	46	A1,A15,A18,A19,A2,A6,A7,B100,B109,B115,B124,B126,B15,B30,B36,B37,B42,B43,B44,B60,B61,B63,B71,B73,B78,B90,B92,B95,B99,C10,C17,C29,C31,C32,C38,C39,C40,C42,C60,C62,C67,C72,C76,C8,C86,D8
`Chr8:1327234`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A5,B101,B103,B109,B117,B122,B135,B137,B17,B21,B24,B34,B35,B53,B55,B58,C14,C16,C55,C60,C66,C69,C84
`Chr8:1327238`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A1,A18,A19,A2,A22,A6,A7,A9,B100,B109,B115,B124,B126,B15,B30,B36,B37,B42,B43,B44,B60,B61,B63,B69,B71,B73,B78,B90,B92,B95,B99,C17,C29,C31,C32,C38,C39,C42,C44,C54,C60,C62,C67,C72,C76,C86
`Chr8:1327277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B104,B105,C38,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778285.1

395 aa

198

395

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

LRR_RPS2

PF23598 LRR_14 16-309 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 143-276 aa PF23247 LRR_RPS2 244-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778285.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	16	309	1.7e-36	126.4	Leucine-rich repeat region
`XP_057778285.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	143	276	1.7e-39	135.4	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057778285.1`	Pfam	`PF23247`	LRR_RPS2	Repeat	244	360	3.9e-08	34.1	Plant disease resistance protein RPS2-like, leucine-rich repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922302.1
ATGAAGAACAAATCGAGTCAAATCCCAAAAGAAATTGCAAAATCTTTGCGTACGTTACTAATAACATCCAAAGGTGATATTTCTGATATCAACTTCTCAGACTTGGAAAGTTTGCATGTTTTACGTCTTGACTCTCAAGTTAAAGAGCTGCCACGTTCGATTCAAAAGTTGATACATTTGAGAGATTTTGACATTTCAAAGACAAGTATTAAAGATTTGCCGGATTGGATTGGTGAATTCTTTCACTTGCAGACGTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997023
ATGAAGAACAAATCGAGTCAAATCCCAAAAGAAATTGCAAAATCTTTGCGTACGTTACTAATAACATCCAAAGGTGATATTTCTGATATCAACTTCTCAGACTTGGAAAGTTTGCATGTTTTACGTCTTGACTCTCAAGTTAAAGAGCTGCCACGTTCGATTCAAAAGTTGATACATTTGAGAGATTTTGACATTTCAAAGACAAGTATTAAAGATTTGCCGGATTGGATTGGTGAATTCTTTCACTTGCAGACGTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778285.1
MKNKSSQIPKEIAKSLRTLLITSKGDISDINFSDLESLHVLRLDSQVKELPRSIQKLIHLRDFDISKTSIKDLPDWIGEFFHLQTLRANKYCLEKLPSTVKYLINLRHLYINQWVELPMGIGGLTSLQTLKYFPVGDENGCKIEELGSLNNLKGELEIHNLERVHDKEEAGKANLFKKSKILELHLNWDWRREGERNDEGVLEGLQPHSDLRELKIWGFNGSRFPLWTEKMSVRDAPQGSWVLLNNLMSLFLFHCRECEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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