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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000201`

染色体: Chr08 坐标: 1367512-1370799 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000201`
名称	SmilChr08G000201
描述	putative disease resistance protein RGA3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1367512 - 1370799 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997026`
GeneID	`130997026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997026`
原始查询	`SmilChr08G000201`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA3
产物	putative disease resistance protein RGA3
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=31.9; qcov=0.854; evalue=2.82e-118; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=32; qcov=1.07; evalue=1.56e-132; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778288.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778288.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778288.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778288.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1367512`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:1367512`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B4
`Chr8:1367519`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:1367519`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr8:1367521`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B132,B29,B56,B66,B93,B96,C27,C38,C63
`Chr8:1367526`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B132,B29,B56,B66,B93,B96,C27,C38,C63
`Chr8:1367528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:1367529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:1367543`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:1367543`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr8:1367545`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:1367545`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778288.1

1095 aa

548

1095

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 9-98 aa PF00931 NB-ARC 186-351 aa PF23559 WHD_DRP 435-506 aa PF23598 LRR_14 543-843 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 677-810 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778288.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	98	2.3e-19	70.0	Rx N-terminal domain
`XP_057778288.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	186	351	4.2e-29	102.0	NB-ARC domain
`XP_057778288.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	435	506	2.1e-24	86.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057778288.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	543	843	5.3e-42	144.6	Leucine-rich repeat region
`XP_057778288.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	677	810	1.1e-45	155.3	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922305.1
ATGGAAGGGGAAGCTGCTGCCGCCGTCCTTCAAGTTCTAGTTCAAAATGTCATCGACCTTGGCAAGAAAGAGATCTCTCAGATCCGAGATCTCCACAAAAATGCAGAAAAGCTAACTAAGAGTCTCGAAACCATCCAGAAATACTTGAAGGATGCCGAGACGCGTGACATCACCAGCGAATTAGCTGTGAAGGAGTGGCTGAAGAAGCTTGAAGACGTGGCTTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAACTCAACTATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997026
ATGGAAGGGGAAGCTGCTGCCGCCGTCCTTCAAGTTCTAGTTCAAAATGTCATCGACCTTGGCAAGAAAGAGATCTCTCAGATCCGAGATCTCCACAAAAATGCAGAAAAGCTAACTAAGAGTCTCGAAACCATCCAGAAATACTTGAAGGATGCCGAGACGCGTGACATCACCAGCGAATTAGCTGTGAAGGAGTGGCTGAAGAAGCTTGAAGACGTGGCTTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAACTCAACTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778288.1
MEGEAAAAVLQVLVQNVIDLGKKEISQIRDLHKNAEKLTKSLETIQKYLKDAETRDITSELAVKEWLKKLEDVAFDADNVLDELNYHILSDQIKPAEPEEEKIPSCFSRLSCFSCCKNLSRSRNMALKIKDINEHLESINKEATDLGLVGRLDNAPALVITTMETDSFTLDPIFIGRDDVELEIVEMLTNSITTDEKSLSTLAIVGIGGLGKTTLTRKVFNHAKMKSRFGSRIWVHVSPNFDPIILFKKILNKLTSYPVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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