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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000206`

染色体: Chr08 坐标: 1400831-1404217 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000206`
名称	SmilChr08G000206
描述	putative disease resistance protein RGA3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1400831 - 1404217 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999836`
GeneID	`130999836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999836`
原始查询	`SmilChr08G000206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA3
产物	putative disease resistance protein RGA3
Arabidopsis	`AT1G27180` (AT1G27180) disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839607] identity=36.5; qcov=0.431; evalue=1.3e-07; confidence=low
Rice	`Os01g0536466` (OSJNBa0086A10.25) - identity=38.4; qcov=0.569; evalue=4.45e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781493.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057781493.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781493.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781493.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781493.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1402337`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A9,B31,B62,B89,C2,C41,C50,C61,C73,C81,C87
`Chr8:1403223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B64,B66,C87
`Chr8:1403243`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A9,B132,B29,B51,B56,B66,B93,B96,C27,C35,C38,C43,C63
`Chr8:1403276`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A21,B138,B14,B33,B49,B56,B60,B73,B77,B78,B79,B89,B96,C1,C13,C17,C25,C32,C4,C5,C51,C63,C68,C7,C77,D10,D2,D8
`Chr8:1403290`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A14
`Chr8:1403290`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A14
`Chr8:1403296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C76
`Chr8:1403299`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A21,B11,B133,B138,B14,B19,B22,B33,B49,B56,B60,B73,B77,B78,B79,B86,B89,B96,C1,C13,C17,C25,C32,C4,C5,C51,C63,C68,C7,C74,C77,D10,D2,D8
`Chr8:1403301`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A21,B11,B133,B138,B14,B19,B22,B33,B49,B56,B60,B73,B77,B78,B79,B86,B89,B96,C1,C13,C17,C25,C32,C4,C5,C51,C63,C68,C7,C74,C77,D10,D8
`Chr8:1403307`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A14
`Chr8:1403307`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A14
`Chr8:1403313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781493.1

197 aa

197

LRR_R13L1-DRL21

PF25019 LRR_R13L1-DRL21 88-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781493.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	88	150	2.1e-09	38.1	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093599.1
TTGAAGTGTATAAATTCATCACTCTATGGAACTGTGAACAAGGACACGCGCATTGTTTTTCCAGCTCTCGAGAGGTTGGAATTGTATTTTATGCCTAAGCTGGCAGAGTGGGCAGAAATAGAAATTTCGGATGGAAGTGAAGTGAAGCTATTTCCTCGCCTCCAACATTTGAAAATTATTGGTTGCCAGAAATTGATGAGTGTTCCAAGTCATGTCTCGTCATGCCTTGAATTTCTGTGGATTGATGGGATCGGTGTGGA...

XM_057925510.1
TTGAAGTGTATAAATTCATCACTCTATGGAACTGTGAACAAGGACACGCGCATTGTTTTTCCAGCTCTCGAGAGGTTGGAATTGTATTTTATGCCTAAGCTGGCAGAGTGGGCAGAAATAGAAATTTCGGATGGAAGTGAAGTGAAGCTATTTCCTCGCCTCCAACATTTGAAAATTATTGGTTGCCAGAAATTGATGAGTGTTCCAAGTCATGTCTCGTCATGCCTTGAATTTCTGTGGATTGATGGGATCGGTGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999836
ATGCAATGCGACGCCTCCAAATTGATAAGTTACTGCTGGAATTTGCGAGAAATATCAGATAGGTGCGGAGAAGAAGAATCAGAAGGAAGAAGCTTCCCAATCACATCCCTCCCTATATTCCCTCGTCTAACAAAATTGACAATCAAAGGCGTTCCTAAATTAAGTTTGGAGACTGTGGATGGCATATTGCAAGGATGCTGCCACTCACTTTATGAGTTATATTTGTGGGGGATGGAAAGTTGGGAATGCATGCCGGAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781493.1
MQCDASKLISYCWNLREISDRCGEEESEGRSFPITSLPIFPRLTKLTIKGVPKLSLETVDGILQGCCHSLYELYLWGMESWECMPESIQHLTALTSLCLIDFGMEELPEWFGNLSSLKSLQLYNFKRLRRLPSMDAMRRLTTLKRLVIKRCPELVIKSEADYEWPKVSHIPHIEIDDRPPIHRRRPESWIQPFPINY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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