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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000207`

染色体: Chr08 坐标: 1404517-1406090 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000207`
名称	SmilChr08G000207
描述	putative disease resistance protein RGA4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1404517 - 1406090 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997030`
GeneID	`130997030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997030`
原始查询	`SmilChr08G000207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA4
产物	putative disease resistance protein RGA4
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=31; qcov=1.02; evalue=1.08e-55; confidence=low
Rice	`Os08g0543500` - identity=34; qcov=1.06; evalue=5.86e-70; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778291.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778291.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778291.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778291.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1404540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A16,B109,B131,B14,B22,B39,B52,B6,B7,C25,D5
`Chr8:1404553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr8:1404558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:1404578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B76,C5
`Chr8:1404582`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B8
`Chr8:1404582`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B8
`Chr8:1404616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:1404624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:1404626`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C12,C45
`Chr8:1404626`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C12,C45
`Chr8:1404631`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C12,C45
`Chr8:1404631`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C12,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778291.1

498 aa

249

498

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

PF18052 Rx_N 9-97 aa PF00931 NB-ARC 181-320 aa PF23559 WHD_DRP 402-473 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778291.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	97	3.9e-23	82.1	Rx N-terminal domain
`XP_057778291.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	181	320	6e-23	82.0	NB-ARC domain
`XP_057778291.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	402	473	1.9e-24	86.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922308.1
ATGGAAGGAGAAGCTGCTGCCGCCGTTCTTCAAGTTCTAGTTCAAAACCTCGTCGACCTTTGCAAGAAAGAGATCTCTCAGATCCGAGGTGTCCGCAAAGATGCAGAAAAGCTAGCTGGGAGTCTCGACATGATCAAAAAATTCTTGAACGATGCCGAGAAGCGTGACATCACCGGCGAAGCTGTCAAGGGTTGGCTGGAGAAGCTTGAAGACGTAGCTTTTGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997030
ATGGAAGGAGAAGCTGCTGCCGCCGTTCTTCAAGTTCTAGTTCAAAACCTCGTCGACCTTTGCAAGAAAGAGATCTCTCAGATCCGAGGTGTCCGCAAAGATGCAGAAAAGCTAGCTGGGAGTCTCGACATGATCAAAAAATTCTTGAACGATGCCGAGAAGCGTGACATCACCGGCGAAGCTGTCAAGGGTTGGCTGGAGAAGCTTGAAGACGTAGCTTTTGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778291.1
MEGEAAAAVLQVLVQNLVDLCKKEISQIRGVRKDAEKLAGSLDMIKKFLNDAEKRDITGEAVKGWLEKLEDVAFDADNVLDEINYHNLSKQIKPAEPEEEKVPSCFSCFKHISRSRNMALKIKEINEKLESINEEAVKFGLVEKFANEPTLVIASSETDSSYHDPIFIGRDNVASEIVEKLTNSITTDESRDETRFGSHIWVHVSPNFDAITLFKKILNNLTSCQVENASREDILAKLKEALKDKTYLLVLDDVWNEDLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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